Alternative workflow for COVID-19 diagnosis using direct RT-PCR screening

ABSTRACT

Objective: COVID-19 is presently the most serious public health concern and diagnosis is a principal tool for controlling and monitoring the spread of the disease. This study aimed to evaluate the efficiency of direct RT-PCR (dRT-PCR) for detection of SARS-CoV-2. Methods: Twenty-seven nasopharyngeal swabs from symptomatic individuals were evaluated. Standard RT-PCR was conducted, and for dRT-PCR the samples were preheated before amplification. Results: Positive agreement was 63.2% and negative agreement was 100%, being moderately in accord. Conclusion: dRT-PCR may be an alternative for screening symptomatic patients and a reliable option during an eventual shortage of viral RNA purification kits.

RESUMO

Objetivo: A COVID-19 é atualmente um sério problema de saúde pública e o diagnóstico é a principal ferramenta para controlar e monitorar a propagação da doença. Este estudo teve como objetivo avaliar a eficiência da RT-PCR direta (dRT-PCR) para detecção do SARS-CoV-2. Métodos: Vinte e sete amostras de swab nasofaríngeo de indivíduos sintomáticos foram avaliados. A RT-PCR padrão foi realizada e para a dRT-PCR as amostras foram pré-aquecidas antes da amplificação. Resultados: A concordância positiva foi de 63,2% e a concordância negativa foi de 100%, sendo moderadamente concordante. Conclusão: A dRT-PCR pode ser uma alternativa para a triagem de pacientes sintomáticos e uma opção confiável durante uma eventual escassez de kits de purificação de RNA viral.