Virtual screening based on molecular docking of lysosomotropic compounds as therapeutic agents for COVID-19 / Triagem virtual baseada no encaixe molecular de compostos lisossomotrópicos como agentes terapêuticos para COVID-19
J. Health Biol. Sci. (Online)
;
10(1): 1-12, 01/jan./2022. tab, ilus
Artículo
en Inglés
| LILACS
| ID: biblio-1378476
ABSTRACT
Objective: Analyze lysosomotropic agents and their action on COVID-19 targets using the molecular docking technique. Methods: Molecular docking analyses of these lysosomotropic agents were performed, namely of fluoxetine, imipramine, chloroquine, verapamil, tamoxifen, amitriptyline, and chlorpromazine against important targets for the pathogenesis of SARS-CoV-2. Results: The results revealed that the inhibitors bind to distinct regions of Mpro COVID-19, with variations in RMSD values from 1.325 to 1.962 Å and binding free energy of -5.2 to -4.3 kcal/mol. Furthermore, the analysis of the second target showed that all inhibitors bonded at the same site as the enzyme, and the interaction resulted in an RMSD variation of 0.735 to 1.562 Å and binding free energy ranging from -6.0 to -8.7 kcal/mol. Conclusion: Therefore, this study allows proposing the use of these lysosomotropic compounds. However, these computer simulations are just an initial step toward conceiving new projects for the development of antiviral molecules.
RESUMO
Objetivo: aAnalisar agentes lisossomotrópicos e sua ação em alvos de COVID-19 usando a técnica de docking molecular. Métodos: Foram realizadas análises de docagem molecular destes agentes lisossomotrópicos, nomeadamente de fluoxetina, imipramina, cloroquina, verapamil, tamoxifeno, amitriptilina e clorpromazina contra alvos importantes para a patogenia do SARS-CoV-2. Resultados: Os resultados revelaram que os inibidores se ligam a regiões distintas do Mpro COVID-19, com variações nos valores de RMSD de 1.325 a 1.962 Å e energia livre de ligação de -5,2 a -4,3 kcal/mol. Além disso, a análise do segundo alvo mostrou que todos os inibidores se ligaram no mesmo sítio da enzima, e a interação resultante em uma variação de RMSD de 0,735 a 1.562 Å e energia livre de ligação variando de -6,0 a -8,7 kcal/mol. Conclusão: Portanto, este estudo permite propor o uso desses compostos lisossomotrópicos. No entanto, essas simulações em computador são apenas um passo inicial para a concepção de novos projetos para o desenvolvimento de moléculas antivirais.
Texto completo:
Disponible
Índice:
LILACS (Américas)
Asunto principal:
SARS-CoV-2
/
COVID-19
Tipo de estudio:
Estudio diagnóstico
/
Estudio de tamizaje
Idioma:
Inglés
Revista:
J. Health Biol. Sci. (Online)
Asunto de la revista:
Cincias da Sa£de
/
Disciplinas das Cincias Biol¢gicas
Año:
2022
Tipo del documento:
Artículo
País de afiliación:
Brasil
Institución/País de afiliación:
Christus University Center (UNICHRISTUS)/BR
/
Christus University Center (UNICHRISTUS),/BR
/
Federal University of Ceará/BR
/
University of Ceará, Limoeiro do Norte, Ceará/BR
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