Análisis del genoma de pycnoporus cinnabarinus mediante electroforesis de campo pulsado / Pycnoporus cinnabarinus genome analysis by pulse field gel electrophoresis

RESUMEN

En el presente trabajo se describe la separación óptima de moleculas de DNA cromosómico intacto del hongo filamentoso Pycnoporus cinnabarinus, mediante electroforesis de campo pulsado usando un sistema de contorno de campo eléctrico homogéneo (CHEF), con un electrodo hexagonal. Se estudió una serie de condiciones experimentales en las cuales se hizo variar la duración del intervalo de tiempo en cada dirección del campo y el tiempo total de la corrida. De esta manera fué posible separar el DNA cromosómico de P. cinnabarinus en cuatro bandas que, dependiendo de las condiciones electroforesis, pueden ser resueltas por lo menos en siete bandas. Utilizando los patrones de migración del DNA cromosómico de Saccharomyces cerevisiae y Schawanniomyces occidentalis como estándar, estimamos que los tamaños moleculares del DNA cromosómicos de P.cinnabarinus oscilan entre 1.9 y 2.5 megabases (mb)