O efeito da estratificação populacional e outras variáveis de confusão em estudos genéticos de associação: investigação de genes candidatos para a dependência de cocaína / The effect of population stratification and other confounders on genetic association studies: investigation of candidate genes for cocaine dependence

RESUMO

Estudos populacionais de marcadores genéticos têm sido vistos com reservas devido aos baixos índices de reprodutibilidade. O objetivo dessa tese foi investigar a influência da estratificação populacional (EP) e de outras variáveis de confusão em estudos envolvendo 699 dependentes de cocaína, 866 controles e polimorfismos nos genes período (per) 1 e 2. A presença de EP foi confirmada com a contribuição de três subpopulações similarmente distribuídas nos casos e controles, através do uso de 24 marcadores populacionais. A correção estatística para EP e para a variável sexo revelou estimativas de risco de 1.30 e 1.34 para os individuos com os alelos C e A dos SNPs rs2304911 e rs2253820, no gene per1, respectivamente; e de até 1.4 para o haplótipo de risco (CA), sugerindo a participação desse gene na dependência de cocaína / Population studies investigating specific genetic factors are regarded with skepticism, due to the low rate of reproducibility of the results published. The main objective of this thesis was to investigate the influence of population stratification, and other confounders, in 699 cocaine dependents, 866 controls and polymorphisms on association studies involving the period genes (per) 1 and 2. The presence of stratification was confirmed using population markers with contributions from three subpopulations, but was similar in cases and controls. Statistical correction for stratification and gender, revealed odds ratio estimations of 1.30 and 1.34 for alleles C and A of the per1 SNPs rs2304911 and rs2253820, respectively, and 1.4 for the CA risk haplotype, suggesting a role for this gene in cocaine dependence...