G and P rotavirus genotypes in stool samples from children in Teresina, State of Piauí

ABSTRACT

A total of 123 stool specimens collected in Teresina, Piauí between 1994 and 1996, from 0 to 2-year-old children with diarrhea, were used for this study. Molecular characterization of the G and P rotavirus genotypes was performed using the reverse transcriptase polymerase chain reaction. The following results were obtained for the P genotypes P[8] (17. 1 percent), P[1] (4. 9 percent), P[4] (3. 3 percent), P[6, M37] (2. 4 percent) and mixtures (27. 6 percent). The P[1]+P[8] mixture was found in 19. 5 percent of the samples. For the G genotypes, the results were G1 (25. 2 percent), G5 (13. 8 percent), G2 (2. 5 percent), G4 (2. 5 percent), G9 (0. 8 percent) and mixtures (41. 5 percent). G1+G5 was the mixture most frequently found (12. 1 percent). Our results showed unusual combinations such as P[1]G5 and P[1]+P[8]G5. The high percentage of mixtures and unusual combinations containing mixtures of human and animal rotavirus genotypes strongly suggests the possibility of gene reassortment and interspecies transmission.

RESUMO

Um total de 123 amostras fecais de crianças de 0 a 2 anos com diarréia, coletadas em Teresina, Piauí, entre 1994 e 1996 foi utilizada neste estudo. Para a caracterização molecular dos genótipos G e P de rotavírus, foram realizadas as reações de transcriptase reversa e reação em cadeia pela polimerase. Os seguintes resultados foram obtidos para o genótipo P P[8] (17,1 por cento), P[1] (4,9 por cento), P[4] (3,3 por cento), P[6, M37] (2,4 por cento) e misturas (27,6 por cento). A mistura P[1]+P[8] foi encontrada em 19,5 por cento das amostras. Para o genótipo G os resultados foram G1 (25,2 por cento), G5 (13,8 por cento), G2 (2,5 por cento), G4 (2,5 por cento), G9 (0,8 por cento) e misturas (41,5 por cento). A mistura G1+G5 foi a mais freqüentemente encontrada (12,1 por cento). Nossos resultados mostram combinações não usuais como P[1]G5 e P[1]+P[8]G5. A alta porcentagem de misturas e as combinações não usuais contendo misturas de genótipos de rotavirus humanos e animais sugerem fortemente a possibilidade de rearranjo genético e transmissão interspecies.