Detection and partial molecular characterization of Grapevine fleck virus, Grapevine virus D, Grapevine leafroll-associated virus -5 and -6 infecting grapevines in Brazil / Detecção e caracterização molecular parcial de Grapevine fleck virus, Grapevine virus D, Grapevine leafroll-associated virus -5 e -6 que infectam videiras no Brasil
Ciênc. rural
;
42(12): 2127-2130, dez. 2012. tab
Artículo
en Inglés
| LILACS
| ID: lil-658056
ABSTRACT
Grapevine fleck, rugose wood and leafroll are three grapevine viral diseases whose causal agents (or associated viruses) respectively are Grapevine fleck virus (GFkV), Grapevine virus D (GVD) and Grapevine leafroll-associated virus 5 and 6 (GLRaV-5 and -6). The objective of this work was to perform a partial molecular characterization of local isolates of these four viral species that infect grapevines. The nucleotide and deduced amino acid sequences of complete genes of the coat protein (CP) (of GFkV), the CP and the RNA binding protein (of GVD), the CP and the partial hHSP70 gene (of GLRaV-5) and the partial hHSP70 gene (of GLRaV-6) were aligned and compared in silico with other isolates. These data extend the available information about Brazilian isolates of GFkV, GLRaV-5 and -6, and reports for the first time the GVD occurrence in Brazil.
RESUMO
Mancha das nervuras, lenho rugoso e enrolamento das folhas são três doenças virais da videira, cujos agentes causais (ou vírus associados) são o Grapevine fleck virus (GFkV), o Grapevine virus D (GVD) e os Grapevine leafroll-associated virus 5 e 6 (GLRaV-5 e -6), respectivamente. O objetivo deste trabalho foi realizar a caracterização molecular parcial de isolados locais dessas quatro espécies virais que infectam videira. As sequências de nucleotídeos e de aminoácidos deduzidos dos genes completos da proteína capsidial (CP) (do GFkV), da CP e da RNA binding protein (do GVD), da CP do GLRaV-5 e parte do gene codificador da hHSP70 do GLRaV-5 e -6 foram alinhadas e comparadas in silico com sequências de outros isolados. Os dados obtidos expandem a informação existente sobre isolados brasileiros de GFkV, GLRaV-5 e - 6 e relatam pela primeira vez a ocorrência do GVD no Brasil.
Texto completo:
Disponible
Índice:
LILACS (Américas)
Tipo de estudio:
Estudio diagnóstico
/
Factores de riesgo
País/Región como asunto:
America del Sur
/
Brasil
Idioma:
Inglés
Revista:
Ciênc. rural
Asunto de la revista:
Ciencia
/
Salud Ambiental
Año:
2012
Tipo del documento:
Artículo
País de afiliación:
Brasil
Institución/País de afiliación:
Embrapa Uva e Vinho/BR
/
Instituto Biológico de São Paulo/BR
/
Universidade Estadual de Maringá (UEM)/BR
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