Análise da suscetibilidade ao câncer colorretal em indivíduos brasileiros por genotipagem de polimorfismos de nucleotídeo único conhecidos / Analysis of the susceptibility to colorectal cancer in Brazilian Individuals through genotyping known single nucleotide polymorphisms

RESUMO

O câncer colorretal (CCR) é um dos cânceres mais prevalentes no mundo, o terceiro mais comum em homens e o segundo em mulheres, sendo a quarta maior causa de mortes por câncer. As taxas de incidência do CCR vêm aumentando nos países em desenvolvimento, como o Brasil, representando a terceira neoplasia maligna mais frequente em ambos os sexos. Suas causas são multifatoriais e interdependentes, com fatores de risco genéticos e ambientais, sendo a história familial um dos principais componentes. A herdabilidade do CCR é de aproximadamente 35%, sendo que as síndromes hereditárias respondem por até 6% dos casos. Recentemente, estudos de associação em larga escala genômica (GWAS) vêm demonstrando que parte do risco genético se deve a variantes comuns de baixa penetrância, como os polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs). Até o momento, GWAS em populações de ancestralidade europeia identificaram cerca de 20 SNPs que, individualmente, conferem pouco efeito no aumento do risco do CCR mas, conjuntamente, respondem por grande parte do risco populacional. Estudos replicativos em populações não-europeias têm obtido pouco poder para detectar associações significativas. Diante disso, os objetivos do presente estudo foram: identificar dez SNPs descritos em populações europeias em indivíduos da população brasileira; calcular as frequências alélica e genotípica dos dez SNPs nos casos e controles; determinar a magnitude do efeito dos alelos sobre o risco de CCR e correlacionar os alelos de risco com as características clínico-patológicas e a história familial. Foram incluídos 1.467 indivíduos (727 casos e 740 controles) que, após assinatura do TCLE, coletaram sangue para a amplificação do DNA e genotipagem dos SNPs na plataforma de qPCR 7900HT com ensaios TaqMan e análise com o software SDS2.3. A taxa global de genotipagem foi maior do que 95% e não houve desequilíbrio de Hardy-Weinberg entre os casos e controles. 51% dos casos eram do sexo masculino...

ABSTRACT

Colorectal cancer (CRC) is one of the most prevalent cancers worldwide, the third most common cancer in men and the second one in women, and the fourth leading cause of all cancer deaths. CRC incidence rates have been increasing specially in developing countries, such as Brazil, where is the third most frequent cancer in both genders. Etiology of CRC is multifactorial, both environmental and genetic risk factors interacting with each other, of whom family history plays a special role. CRC heritability is about 35% and Mendelian syndromes respond for 6% of the cases. Recently, genome-wide association studies (GWAS) have showed that part of the risk is due to common low penetrant variants, such as single nucleotide polymorphisms (SNPs). Approximately 20 SNPs have been discovered through GWAS from European-descent populations, each one with modest size effects on the CRC risk, but collectively, make great part of populational risk. Non-European replication studies have not acheived enough power to detect significant association. Thus, the aims of the present study were: (1) to identify ten SNPs previously detected in European populations in the Brazilian population; (2) to calculate allelic and genotypic frequencies of the ten SNPs in cases and controls; (3) to detect effect sizes of the risk alleles and (4) correlate risk with clinical pathological characteristics and family history. 1,467 individuals (727 cases and 740 controls) were included, who signed consent forms to get their blood drawn for DNA amplification and SNP genotyping through qPCR in 7900HT plataform with TaqMan assays and analysis with SDS2.3 software. The overall genotyping rate was above 95% and there was no deviation from Hardy-Weinberg equilibrium among cases and controls...