An automated annotation tool for genomic DNA sequences using GeneScan and BLAST.

Lynn, A M; Jain, C K; Kosalai, K; Barman, P; Thakur, N; Batra, H; Bhattacharya, A

Lynn, A M; Jain, C K; Kosalai, K; Barman, P; Thakur, N; Batra, H; Bhattacharya, A.

J Genet ; 2001 Apr; 80(1): 9-16

Artículo en Inglés | IMSEAR | ID: sea-114357

ABSTRACT

ABSTRACT

Genomic sequence data are often available well before the annotated sequence is published. We present a method for analysis of genomic DNA to identify coding sequences using the GeneScan algorithm and characterize these resultant sequences by BLAST. The routines are used to develop a system for automated annotation of genome DNA sequences.

Asunto(s)

Algoritmos; Animales; Células Eucariotas; Evolución Molecular; Análisis de Fourier; Genética Microbiana; Genómica; Plasmodium falciparum/genética; Análisis de Secuencia de ADN; Programas Informáticos

Texto completo

Imprimir

XML

Buscar en Google

Texto completo: Disponible Índice: IMSEAR (Asia Sudoriental) Asunto principal: Plasmodium falciparum / Algoritmos / Programas Informáticos / Análisis de Secuencia de ADN / Evolución Molecular / Genómica / Células Eucariotas / Análisis de Fourier / Genética Microbiana / Animales Idioma: Inglés Revista: J Genet Año: 2001 Tipo del documento: Artículo

Similares

MEDLINE

LILACS

LIS

Texto completo

Imprimir

XML

Buscar en Google