Un reto biomédico: facilitar la disponibilidad informativa acerca de la relación entre la microbiota intestinal, medicamentos y vacunas / A biomedical challenge: to facilitate the availability of information about the relationship between gut microbiota, drugs and vaccines / Um desafio biomédico: facilitar a disponibilidade de informações sobre a relação entre a microbiota intestinal, medicamentos e vacinas

RESUMEN

Resumen El personal biomédico carece de plataformas informatizadas que resuman los principales mecanismos de colaboración entre los microbios intestinales y los seres humanos en cuanto a la absorción y transformación de los medicamentos o vacunas y sus respuestas homeostáticas. Por esta razón, el presente trabajo tiene como objetivo aportar evidencias y recomendaciones para el diseño de una plataforma de consulta biomédica, referente a esta relación, lo cual permitirá la valoración de la posible inclusión de la taxa y abundancia microbiana intestinal en los protocolos de evaluación de la efectividad de los mismos. La encuesta realizada a un grupo de profesionales, destinada a la verificación de las posibilidades de acceso y especificidad de este tipo de información posibilitó la identificación de los tópicos principales para la conexión entre grupos de medicamentos, estructura tridimensional, moduladores y mediadores de la respuesta homeostática, biomarcadores, relación inter-reinos y mecanismos patogénicos, de manera que se fusione toda la información "ómica" humanomicrobiota en una plataforma dentro de la página del NCBI, la cual se propone que se denomine Pharmacolobiomic o Pharmaco-metagenomic. La información existe en las bases de datos contenidas en NCBI-NIH, según la búsqueda realizada y el filtrado a partir de 28 628 referencias. A partir de la presente propuesta se demostró la necesidad de contar con una plataformafarma cometagenómica que resuma el papel de la microbiota intestinal en el metabolismo y la efectividad de los fármacos y vacunas; así como disponer de la actualización sistemática para los profesionales en cuanto a la microbiota como biomarcador, en los protocolos de ensayos clínicos.

ABSTRACT

Abstract Biomedical staff lacks a computer platform that summarises the main mechanisms of collaboration between intestinal microbes and humans, related to the absorption and transformation of drugs and vaccines and their ho-meostatic responses. For this reason, the aim of this work is to provide some evidences and recommendations for the design of a biomedical consultation platform, about the relationship between the microbiota and the effect of drugs or vaccines. These evidences will support the assessment for inclu¬sion of taxa and gut microbial abundance, as a part of clinical protocols of effectiveness. The survey carried out on a group of biomedical professionals, aimed at verifying the possibilities of access and specificity of this type of information made it possible to identify the main topics for the connection between drug groups, three-dimensional structure, modulators and mediators of the homeostatic response, biomarkers, inter-kingdom relationship and pathogenic mechanismsin such a way that all the human-microbiota "omics" information will be shown into a sub-platform within NCBI-NIH, which could be called Pharmacolobiomic or Pharmaco-metagenomic. The information is present in the databases contained in the NCBI, taking into account this search and filtering, from 28 628 references. Based on this proposal, the need for a pharmacometagenomic platform that summarises the role of the intestinal microbiota in the metabolism and effectiveness of drugs and vaccines was demonstrated, as well as having the systematic update for professionals about the microbiota as a biomarker, in clinical trial protocols.

RESUMO

Resumo O pessoal biomédico carece de plataformas computadorizadas que resumam os principais mecanismosde colaboração entre micróbios intestinais e seres humanos, em termos de absorção e transformação demedicamentos e vacinas e suas respostas homeostáticas. Por essa razão, este trabalho visa fornecer evidênciase recomendações para o desenho de uma plataforma de consulta biomédica, referente a esta relação;o que permitirá avaliar a possível inclusão dos táxons e da abundância microbiana intestinal nosprotocolos de avaliação da sua eficácia. A pesquisa realizada em um grupo de profissionais, teve comoobjetivo verificar as possibilidades de acesso e especificidade desse tipo de informação; possibilitouidentificar os principais tópicos para a conexão entre grupos de medicamentos, estrutura tridimensional,moduladores e mediadores da resposta homeostática, biomarcadores, relação inter-reino, mecanismospatogênicos; de forma tal que toda a informação "ômica" humano-microbiota se funde em uma plataformadentro da página do NCBI, à qual se propõe ser chamada de Pharmacolobiomic ou Pharmacometagenomic. A informação existe nas bases de dados contidas em NCBI-NIH, tendo em conta a pesquisarealizada e a filtragem, a partir de 28 628 referências. Com base nessa proposta, foi demonstradaa necessidade de contar com uma plataforma farmacometagenômica que resuma o papel da microbiotaintestinal no metabolismo e eficácia de medicamentos e vacinas; além de ter a atualização sistemáticapara os profissionais quanto à microbiota como biomarcador, nos protocolos de ensaios clínicos.