Evaluation of VITEK 2 Compact and VITEK MS in the identification of coagulase-negative staphylococci isolated from blood cultures / Avaliação do VITEK 2 Compact e VITEK MS na identificação de estafilococos coagulase-negativos isolados de hemoculturas

ABSTRACT

ABSTRACT Introduction: In most clinical laboratories, coagulase-negative staphylococci (CNS) are classified through their biochemical characteristics using traditional and/or automated phenotypic methods. However, identification by phenotypic method is a great challenge despite the improvement in identification by automated systems in recent years. Objective: The main objective was to compare the identification of CNS between two automated methods: phenotypic (VITEK® 2 Compact, bioMérieux) and mass spectrometry (MALDI-TOF VITEK® MS, bioMérieux). Materials and method: 133 CNS isolates from whole blood samples from September 2015 to May 2016 were analyzed. Results: All the 133 isolates were identified by VITEK® 2 Compact as CNS, whereas VITEK MS did not identify seven, and there was uncertainty among three species in one isolate. The two devices had a concordance of 92.8% (117/126) of which 56 Staphylococcus epidermidis, 34 Staphylococcus hominis ssp. hominis, 15 Staphylococcus haemolyticus, 10 Staphylococcus capitis, one Staphylococcus cohnii ssp. urealyticus and one Staphylococcus sciuri. There was disagreement in identification of S. lugdunensis and S. aureus. Conclusion: Through the analysis between the two devices and based on scientific articles comparing the methods involved in the study, it was possible to observe the great biochemical similarity among the coagulase-negative staphylococci species, this being the main limitation of the phenotypic method. The VITEK MS equipment showed high discrimination between species when compared to the gold standard method, besides being rapid and easy to use.

RESUMO

RESUMO Introdução: Estafilococos coagulase-negativos (ECN) estão entre os principais colonizantes de pele e mucosas, atuando como comensais. Apesar de apresentarem baixa virulência, podem causar infecções graves, principalmente quando são utilizados dispositivos invasivos, como cateteres. Como têm grande capacidade de formar biofilme, conseguem atingir rapidamente a corrente sanguínea, o que pode levar à septicemia. Objetivo: O objetivo principal foi comparar a identificação dos ECN entre duas metodologias automatizadas fenotípica (VITEK® 2 Compact, bioMérieux) e espectrometria de massa (MALDI-TOF VITEK® MS, bioMérieux). Materiais e método: Foram analisados 133 isolados de ECN provenientes de amostras de hemoculturas, no período de setembro de 2015 a maio de 2016. Resultados: Todos os 133 isolados foram identificados no VITEK® 2 Compact como ECN, enquanto o VITEK MS não identificou sete amostras; houve incerteza entre três espécies em um isolado. Os dois equipamentos tiveram concordância de 92,8% (117/126), dos quais foram 56 Staphylococcus epidermidis, 34 Staphylococcus hominis ssp. hominis, 15 Staphylococcus haemolyticus, 10 Staphylococcus capitis, um Staphylococcus cohnii ssp. urealyticus e um Staphylococcus sciuri. Houve discordância em uma identificação de S. lugdunensis e S. aureus. Conclusão: Por meio da análise entre os dois equipamentos e com base em artigos científicos que comparam os métodos envolvidos neste estudo, foi possível observar a grande similaridade bioquímica entre as espécies de ECN, sendo esta a principal limitação do método fenotípico. O equipamento VITEK MS apresentou alta discriminação entre as espécies quando comparado com o método gold standard, além da facilidade e da agilidade da técnica.