Análise das frequências dos grupos alélicos e haplótipos HLA -A*, -B* e -DRB1* por cor/raça e regionalidade do Brasil em uma amostra do Registro Brasileiro de Doadores Voluntários de Medula Óssea (REDOME) / [Analysis of the frequencies of allele groups and HLA -A *, -B * and -DRB1 * haplotypes by color / race and regionality of Brazil in a sample from the Brazilian Registry of Bone Marrow Donors (REDOME)]

RESUMO

Para melhorar a assistência aos pacientes que estão em lista de espera para um transplante de medula óssea de um doador não aparentado, é importante caracterizar geneticamente os doadores voluntários de medula óssea que são recrutados pelo REDOME e suas diferenças regionais. O objetivo é descrever as frequências alélicas e haplótipos de HLAA, HLA-B e HLA-DRB1 em todas as regiões do Brasil, assim como por cor/raça usando o banco de dados do REDOME. Esse estudo é composto pela análise de 3.038.286 indivíduos. As frequências dos grupos alélicos HLA e haplótipos foram estimados pelo algoritmo EM. As distâncias genéticas de Nei para cada combinação de amostras também foram calculadas usando as frequências de haplótipos. Todos os grupos alélicos para HLA-A, -B e -DRB1 foram identificados neste estudo. HLA-A*02 (25,9%), HLA-B*35 (11,83%) e HLA-DRB1*13 (13,4%) compreendem os grupos de alelos mais frequentes no REDOME e A*01-B*08-DRB1*03 é o haplótipo mais frequente (2,19%) em nossas amostras. Foi observado através de distâncias genéticas que existem diferenças entre regiões do Brasil e entre os grupos de cor/raça e formações de aglomerados que compartilham semelhanças quando são considerados as frequências de haplótipos. Os resultados relatados aqui são as primeiras análises detalhadas do polimorfismo dos três loci HLA-A*, HLA-B* e HLA-DRB1* na população brasileira. Os dados dos grupos alélicos e das frequências de haplótipos obtidos neste estudo são relevantes para facilitar a pesquisa de doador não-aparentado compatível e pode ser útil para o planejamento nacional de recrutamento de doadores

ABSTRACT

To improve assistance for patients who are on a waiting list for a bone marrow transplant from an unrelated donor, it is important to genetically characterize the volunteer bone marrow donors that are recruited by REDOME and their regional differences. The objective is todescribe the allele and haplotype frequencies of HLA-A, HLA-B and HLA-DRB1 in all Regions of Brazil as well as by its color/race groups using REDOME data set. This study consists of the analysis of 3.038.286 individuals. HLA allelic groups and haplotypesfrequencies were estimated by EM algorithm. Pairwise Nei’s genetic distance for each population combination were also calculated using haplotype frequencies. All allelic groups for HLA-A* HLA-B* HLA-DRB1 were identified in this study. HLA-A*02 (25,9%), HLA-B*35 (11,83%) and HLA-DRB1*13 (13,4%) comprise the most frequent allelic groups in REDOMEand A*01-B*08-DRB1*03 is the most frequent haplotype (2,19%). It was observed through genetic distances that there are differences between regions and race/ethnic groups andformations of clusters that share similarities when considering haplotype frequencies. The results reported here are the first detailed analyses of three loci HLA-A*, HLA-B* e HLADRB1*polymorphisms in Brazilian population. The allelic groups and haplotype frequency data obtained in this study are relevant to facilitate searching for unrelated matched donor and could be helpful for national donor recruitment planning