Predicción de unión de péptidos de Plasmodium falciparum al HLA clase II. Probabilidad, combinatoria y entropía aplicadas a las proteínas MSP-5 y MSP-6 / Plasmodium falciparum binding peptides prediction to HLA class II. Probability, combinatory and entropy applied to MSP-5 and MSP-6 proteins

RESUMEN

Las proteínas de superficie del merozoíto (MSP) son de importancia en la invasión parasitaria al glóbulo rojo. La proteína MSP-5, encontrada en merozoítos libres, tiene un papel en la inmunización de ratones al P. falciparum y P. yoelii, pese a lo cual algunos estudios cuestionan su rol en la invasión. La proteína MSP-6 forma junto con MSP-1 y MSP-7 un complejo en la superficie del merozoíto, liberado del parásito cerca del momento de la invasión al glóbulo rojo. Con el fin de predecir el fenómeno de unión de péptidos de las proteínas de superficie MSP-5 y MSP-6, se aplicó una teoría de unión al HLA clase II, a la totalidad de secuencias de 20 aminoácidos de tales moléculas. Se calcularon los valores de probabilidad, combinatoria y entropía de 168 secuencias nonámeras sobrelapadas de la proteína MSP-5 y 228 de MSP-6. Por último se aplicó la teoría de unión a todos los péptidos nonámeros de tres proteínas construidas computacionalmente, cada una con una longitud de 500 aminoácidos. Para la proteína MSP-5 se predijo un total de 31 secuencias asociadas al macroestado de unión y 137 al de no unión, mientras que se predijo la existencia de 35 secuencias asociadas al macroestado de unión para MSP-6 y 193 al de no unión. Se encontraron respectivamente 100, 111 y 91 secuencias predichas de unión para las tres proteínas teóricas construidas. La predicción teórica de unión de péptidos es útil para facilitar el desarrollo de vacunas, al evidenciar el orden físico-matemático subyacente al fenómeno.(AU)