Identification, classification and expression pattern analysis of sugarcane cysteine proteinases

RESUMO

Proteinases cisteínicas säo peptidil-hidrolases dependentes de um resíduo de cisteína em seu sítio ativo. As propriedades físico-químicas destas proteinases têm sido amplamente caracterizadas, entretanto suas funções biológicas ainda näo foram completamente elucidadas. Elas estäo envolvidas em um grande número de eventos, tais como processamento e degradaçäo protéica, câncer, germinaçäo, morte celular programada e processos de senescência. Diferentes proteinases cisteínicas, classificadas pelo Comitê de Nomenclatura da Uniäo Internacional de Bioquímica e Biologia Molecular (IUBMB) como pertencentes à sub-sub-classe E.C.3.4.22, foram usadas na busca de clusters no banco de dados do SUCEST (SUgarCane EST project), utilizando-se o programa T-BLAST-n. Homologia de seqüências foram encontradas com 76 clusters que correspondem a prováveis proteinases cisteínicas. O alinhamento destas seqüências com a de outras proteases cisteínicas, de diversas origens, forneceu informaçäo quanto à classificaçäo e possível funçäo das proteinases de cana-de-açúcar. Além disso, o padräo de expressäo de cada gene foi postulado a partir da correlaçäo direta com as bibliotecas de cDNA do SUCEST dos quais os clusters foram derivados. Uma vez que nenhum gene de protease cisteínica foi anteriormente evidenciado em cana-de-açúcar, este estudo representa uma etapa inicial para o estudo de novos aspectos bioquímicos, fisiológicos e biotecnológicos destas enzimas.