Uso da bioinformática na diferenciação molecular da Entamoeba histolytica e Entamoeba díspar / Molecular discrimination of Entamoeba histolytica and Entamoeba disparby bioinformatics resources
Acta sci., Health sci
;
30(2)2008. ilus
Article
Dans Portugais
| LILACS
| ID: lil-538854
RESUMO
Amebíase invasiva, causada por Entamoeba histolytica, é microscopicamente indistinguível da espécie não-patogênica Entamoeba dispar. Com auxílio de ferramentas debioinformática, objetivou-se diferenciar Entamoeba histolytica e Entamoeba dispar por técnicas moleculares. A análise foi realizada a partir do banco de dados da National Center for Biotechnology Information; pela pesquisa de similaridade de sequências, elegeu-se o gene da cisteína sintase. Um par de primer foi desenhado (programa Web Primer) e foi selecionada a enzima de restrição TaqI (programa Web Cutter). Após a atuação da enzima, o fragmento foi dividido em dois, um com 255 pb e outro com 554 pb, padrão característico da E. histolytica.Na ausência de corte, o fragmento apresentou o tamanho de 809 pb, referente à E. dispar.
ABSTRACT
Under microscopic conditions, the invasive Entamoeba histolytica is indistinguishable from the non-pathogenic species Entamoeba dispar. In this way, the present study was carried out to determine a molecular strategy for discriminating both species by the mechanisms of bioinformatics. The gene cysteine synthetase was consideredfor such a purpose by using the resources of the National Center for BiotechnologyInformation data bank in the search for similarities in the gene sequence. In this way, a primer pair was designed by the Web Primer program and the restriction enzyme TaqI was selected by the Web Cutter software program. The DNA fragment had a size of 809 bp before cutting, which is consistent with E. dispar. The gene fragment was partitioned in a first fragment with 255 bp and a second one with 554 bp, which is similar to the genetic characteristics of E. histolytica.
Texte intégral:
Disponible
Indice:
LILAS (Amériques)
Sujet Principal:
Maladies parasitaires
/
Biologie informatique
/
Entamoeba histolytica
/
Amibiase
Type d'étude:
Étude pronostique
langue:
Portugais
Texte intégral:
Acta sci., Health sci
Thème du journal:
Medicina
/
Sa£de P£blica
Année:
2008
Type:
Article
Pays d'affiliation:
Brésil
Institution/Pays d'affiliation:
Universidade Estadual de Maringá/BR
/
Universidade Estadual do Oeste do Paraná/BR
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