Análise computacional baseada no desenvolvimento de um pipeline de técnicas ab initio para predição de desordem estrutural protéica em genomas de tripanosomatídeos / Computational analysis based on developing a pipeline of techniques for ab initio prediction of protein structural disorder in the genomes of trypanosomatids

RESUMO

Proteínas são compostas por uma ou mais cadeias de aminoácidos e exibem vários níveis de organização estrutural. Recentemente, uma classe de proteínas conhecidas como IUPs (Intrinsically Unstructured Proteins) foi descoberta e sua principal característica é a ausência de estrutura parcial ou total em seu estado nativo. Devido à sua adaptabilidade intrínseca, tais proteínas participam em muitos. processos biológicos regulatórios incluindo o escape do sistema imune. Utilizando a informação contida no proteoma predito de Leishmania braziliensis, Leishmania major, Leishmania infantum, Trypanosoma cruzi e Trypanosoma brucei, desenvolvemos um pipeline de análise computacional que tem como objetivo a identificação, caracterização e análise de IUPs. Nosso principal objetivo é investigar. as correlações biológicas entre desordem estrutural e as interações parasitohospedeiro.. O pipeline emprega 6 metodologias de predição de desordem, integra informações obtidas através da anotação estrutural e funcional, predição subcelular e o cálculo de propriedades físico-químicas. Como cerne do pipeline de IUPs existe um banco de dados relacional modelado de forma a viabilizar a extração das relações entre as inúmeras variáveis analisadas e gerar os relatórios.