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COI barcode versus morphological identification of Culex ( Culex ) (Diptera: Culicidae) species: a case study using samples from Argentina and Brazil
Laurito, Magdalena; Oliveira, Tatiane MP de; Almiron, Walter Ricardo; Sallum, Maria Anice Mureb.
  • Laurito, Magdalena; Universidad Nacional de Cordoba. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicas y Naturales. Centro de Investigaciones Entomologicas de Cordoba. Instituto de Investigaciones Biologicas y Tecnologicas. AR
  • Oliveira, Tatiane MP de; Universidad Nacional de Cordoba. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicas y Naturales. Centro de Investigaciones Entomologicas de Cordoba. Instituto de Investigaciones Biologicas y Tecnologicas. AR
  • Almiron, Walter Ricardo; Universidad Nacional de Cordoba. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicas y Naturales. Centro de Investigaciones Entomologicas de Cordoba. Instituto de Investigaciones Biologicas y Tecnologicas. AR
  • Sallum, Maria Anice Mureb; Universidad Nacional de Cordoba. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicas y Naturales. Centro de Investigaciones Entomologicas de Cordoba. Instituto de Investigaciones Biologicas y Tecnologicas. AR
Mem. Inst. Oswaldo Cruz ; 108(supl.1): 110-122, 2013. tab, graf
Article Dans Anglais | LILACS | ID: lil-697832
ABSTRACT
Sequences of the cytochrome c oxidase subunit I (COI) mitochondrial gene from adults of 22 Culex ( Culex ) species from Argentina and Brazil were employed to assess species identification and to test the usefulness of COI for barcoding using the best close match (BCM) algorithm. A pairwise Kimura two-parameter distance matrix including the mean intra and interspecific distances for 71 COI barcode sequences was constructed. Of the 12 COI lineages recovered in the Neighbour-joining topology, five confirmed recognised morphological species ( Cx. acharistus , Cx. chidesteri , Cx. dolosus , Cx. lygrus and Cx. saltanensis ) with intraspecific divergences lower than 1.75%. Cx. bilineatus is formally resurrected from the synonymy of Cx. dolosus . Cx. maxi , Cx. surinamensis and the Coronator group species included were clustered into an unresolved lineage. The intraspecific distance of Cx. pipiens (3%) was almost twice the interspecific between it and Cx. quinquefasciatus (1.6%). Regarding the BCM criteria, the COI barcode successfully identified 69% of all species. The rest of the sequences, approximately 10%, 18% and 3%, remained as ambiguously, mis and unidentified, respectively. The COI barcode does not contain enough information to distinguish Culex ( Cux. ) species.
Sujets)


Texte intégral: Disponible Indice: LILAS (Amériques) Sujet Principal: Classification / Complexe IV de la chaîne respiratoire / Culex / Codage à barres de l'ADN pour la taxonomie / Systèmes d'identification animale Type d'étude: Etude diagnostique / Étude pronostique Limites du sujet: Animaux Pays comme sujet: Amérique du Sud / Argentine / Brésil langue: Anglais Texte intégral: Mem. Inst. Oswaldo Cruz Thème du journal: Médecine tropicale / Parasitologie Année: 2013 Type: Article / descriptif de projet Pays d'affiliation: Argentine Institution/Pays d'affiliation: Universidad Nacional de Cordoba/AR

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