Analytical recommendations for SARS-CoV-2 identification by RT-PCR in pediatric patients / Recomendaciones analíticas para la identificación de SARS-CoV-2 por RT-PCR en pacientes pediátricos

ABSTRACT

Abstract Coronavirus disease 2019 (COVID-19) is caused by the severe acute respiratory syndrome 2 coronavirus (SARS-CoV-2) and is currently listed as a global public health emergency. Timely identification and protocol implementations for molecular detection of this virus are vital for medical decision-making. Identification of SARS-CoV-2 infection cases is based on detection of the virus RNA by molecular tests, particularly real-time reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). Technical and operational details specific to each center must be considered to perform the molecular diagnosis of SARS-CoV-2 in pediatric patients. The term “qualified laboratories” involves laboratories in which all users, analysts, and anyone reporting results are trained to develop and interpret results through a procedure implemented previously by an instructor. Such knowledge is essential in detecting and identifying errors during each of its phases pre-analytical, analytical, and post-analytical, which allow the establishment of continuous improvement policies to ensure the quality of the results, but above all, the physical integrity of health workers.

RESUMEN

Resumen La enfermedad por coronavirus de 2019 (COVID-19), causada por el coronavirus del síndrome respiratorio agudo grave 2 (SARS-CoV-2), está catalogada actualmente como una emergencia de salud pública mundial. La oportuna identificación y la implementación de protocolos para la detección molecular de este virus son de vital importancia para la toma de decisiones médicas. La identificación de los casos de infección por SARS-CoV-2 se basa en la detección de ARN del virus mediante pruebas moleculares, específicamente la reacción en cadena de la polimerasa de transcripción inversa (RT-PCR) en tiempo real. Existen detalles particulares de cada centro, tanto técnicos como operacionales, que deben considerarse para llevar a cabo el diagnóstico molecular de SARS-CoV-2 en pacientes pediátricos. El término «laboratorios calificados¼ se refiere a laboratorios en los cuales todos los usuarios, los analistas y cualquier persona que reporta resultados están capacitados para el desarrollo y la interpretación de estos a través de un procedimiento previo implementado por un instructor. Dichos conocimientos son indispensables para la detección y la identificación de errores durante el proceso en cada una de sus fases preanalítica, analítica y posanalítica. Además, permiten establecer políticas de mejora continua que aseguran la calidad de los resultados, pero sobre todo la integridad física de los trabajadores de la salud.