COVID-19 epidemiological surveillance through pool testing focused on asymptomatic healthcare workers in the city of Bahía Blanca / Vigilancia epidemiológica de covid-19 mediante testeos agrupados focalizada en trabajadores de salud asintomáticos en bahía blanca

RESUMEN

RESUMEN INTRODUCCIÓN: Uno de los desafíos más relevantes al comienzo de la pandemia consistió en implementar estrategias dirigidas a prevenir la transmisión del virus SARS-CoV-2 y mitigar el impacto de la COVID-19. El propósito de este estudio fue contribuir a reducir la transmisión comunitaria a través de una iniciativa interinstitucional, cuyos objetivos fueron validar un método de detección de ARN del SARS-CoV-2 e implementar y evaluar la vigilancia en trabajadores de salud asintomáticos de instituciones de salud pública de Bahía Blanca. MÉTODOS: Se validó una prueba de detección del gen E del coronavirus mediante RT-PCR a partir de ARN aislado de hisopados nasofaríngeos. Para aumentar la capacidad de testeo se validó la detección del ARN viral en muestras agrupadas (pooles). Se realizó un estudio de cohorte prospectiva entre el 15/09/20 y el 15/09/21. RESULTADOS: La sensibilidad y especificidad de la prueba en muestras individuales fue del 95% (IC 95% 85%-100%). La sensibilidad de la detección en pooles fue del 73% (IC 95% 46%-99%) y la especificidad, del 100%. A lo largo de la vigilancia se incluyeron 855 trabajadores y 1764 hisopados, con una incidencia acumulada anual de 2,3% (IC 95% 1,2%-3,4%). Se detectaron 20 casos asintomáticos positivos. DISCUSIÓN: El tamizaje de trabajadores de salud asintomáticos en la pandemia contribuyó a reducir el riesgo de brotes hospitalarios. Asimismo, se generó un marco de trabajo interdisciplinario aplicable a otros problemas de salud.

ABSTRACT

ABSTRACT INTRODUCTION: One of the most important challenges at the beginning of the pandemic was to implement strategies to prevent SARS-CoV-2 virus transmission and reduce the impact of COVID-19. The purpose of this study was to contribute to the reduction of community transmission through an interinstitutional initiative, aimed at validating a SARS-CoV-2 RNA detection method, and at implementing and assessing the surveillance of asymptomatic infected healthcare workers (HCWs) at public health institutions in the city of Bahía Blanca. METHODS: To validate a coronavirus RNA detection method, RNA was extracted from nasopharyngeal swabs and identification of the viral E gene was done by RT-PCR. Validation of sample pooling was performed to increase the testing capacity. A prospective cohort study was conducted from 15 September 2020 to 15 September 2021. RESULTS: The sensitivity and specificity of the test in individual samples was 95% (CI 95% 85%-100%). The sensitivity of the pooling strategy was 73% (CI 95% 46%-99%) and the specificity was 100%. A total of the 855 HCWs were included in the surveillance and 1764 swabs were performed, with an annual cumulative incidence of 2.3% (CI 95% 1,2%-3,4%), and 20 positive asymptomatic cases were detected. DISCUSSION: The screening of asymptomatic HCWs during the pandemic contributed to reduce the risk of outbreaks in hospital settings. Moreover, an interdisciplinary team framework applicable to other health problems was generated.