Identification of the Salivary Microbiota of Patients with Oral Cancer in Antofagasta- Chile by Molecular Diagnosis of the 16S rRNA Gene / Identificación de la Microbiota de Saliva de Pacientes con Cáncer Oral de Antofagasta por Diagnóstico Molecular del Gen ARNr 16S

ABSTRACT

ABSTRACT Oral cancer, is part of several cancers that affect head and neck, and that according to numerous studies shows an increase of approximately 3-5 % of all cancers. In the last 10 years there has been an increased interest in saliva for its use as a diagnostic tool, due to its easy access, and non-invasive sample collection, unlike blood samples. Studies of metagenomics to the microbiota of oral cancer patients have shown the presence of some groups in greater proportion, it is postulated that they could be used as markers especially in the saliva of these patients. In Antofagasta the number of patients with this type of cancer increases each year. However, there are no studies on the changes that affect the oral microbiota in these patients. The objective of this study is to contribute to the knowledge of the microbiota present in the saliva of patients with oral cancer in the region of Antofagasta, limiting this study exclusively to the group of cultivable anaerobic bacteria. The strains identified are related to the group of Streptococcus mitis / oralis, S. anginosus and S. gordoni, only one strain is grouped near the cluster that includes S. australis and S. parasanguinis. 36.4 % of the molecularly identified isolates, are closely related to the S. anginosus species described in the literature in oropharyngeal tumors. The same percentage is obtained for the taxa related to the cluster that includes S. mitis, proposed in other studies as a diagnostic indicator in subjects with oral squamous cell carcinoma.

RESUMEN

RESUMEN El de cáncer oral, es parte de un grupo de cáncer que afecta cabeza y cuello, y que según demuestran numerosos estudios va en aumento corresponde aproximadamente al 3-5 % de todos los cánceres. En los últimos 10 años la saliva ha aumentado su interés para su uso como diagnóstico debido a su fácil acceso y recolección no invasiva, a diferencia la sangre. Estudios de metagenómica a la microbiota de pacientes con cáncer bucal han demostrado la presencia de algunos grupos en mayor proporción, se postula que podrían ser utilizados como marcadores especialmente en la saliva de estos pacientes. En Antofagasta el número de pacientes con este tipo de cáncer aumenta cada año, sin embargo no hay estudios sobre los cambios que afectan a la microbiota bucal de estos pacientes. El objetivo de este estudio es contribuir al conocimiento de la microbiota presente en la saliva de los pacientes con cáncer bucal en la región de Antofagasta acotando este estudio exclusivamente al grupo de bacterias anaerobias cultivables. Las cepas identificadas se relacionan con el grupo de Streptococcus mitis/oralis, S. anginosus y S. gordoni, sólo una cepa se agrupa cerca del cluster que incluye a S. australis y S. parasanguinis. Un 36,4 % de los aislados identificados molecularmente se relacionan cercanamente a la especie S. anginosus descrita en la bibliografía en tumores orofaríngeos y el mismo porcentaje se obtiene para los taxones relacionados al cluster que agrupa a S. mitis, propuesto en otros estudios como indicador diagnóstico en sujetos con carcinoma oral de células escamosas.