Ecología evolutiva de escherichia coli / Evolutive ecology of escherichia coli

RESUMEN

Escherichia coli es el organismo mejor conocido en términos de su genética y fisiología. Sin embargo, se sabe poco de su ecología y biología evolutiva. En este trabajo revisamos aspectos de su biología, genómica, ecología genética de poblaciones. Estudios clásicos, basados principalmente en cepas aisladas de humanos, sugerían que E.coli es una especie con una fuerte estructura clonal, con poca o ninguna recombinación. Nosotros hemos ensamblado y analizado una colección llamada IECOL, con más de 2000 cepas provenientes de animales de varios lugares del mundo, de humanos de México y de cepas silvestres de diferentes ambientes. En este trabajo se presentan datos sobre genética de poblaciones y evolución molecular de E.coli obtenidos a partir de esta colección. Estos, junto con otros datos de la literatura reciente, indican que E.coli es un organismo muy diverso, con un genoma extraordinariamente dinámico donde la recobinación es importante, y que las combinaciones exitosas pueden dispersarse de manera epidémica en las poblaciones humanas o animales, dando una falsa señal de clonalidad. Finalmente, se ilustra el potencial de uso de la colección (IECOL) en estudios que estamos realizando sobre la evolución de tasas de mutación, y sobre la evolución de genes patogénicos en la especie