Otimização de metodologia PCR-SSP para identificação de polimorfismos genéticos de TNF e IL2 / Optimization of the PCR-SSP methodology in the identification of TNF and IL2 genetic polymorphisms
Rev. bras. hematol. hemoter
;
31(4): 241-246, jul.-ago. 2009. ilus, tab
Artigo
em Português
| LILACS
| ID: lil-530037
RESUMO
A análise de polimorfismos únicos de nucleotídeos (SNPs) de citocinas pode ser útil em estudos de frequências alélicas e genotípicas em populações saudáveis de diversas regiões, em estudos de associação com doenças infecciosas ou autoimunes, em estudos antropológicos e na evolução pós-transplante. Estes SNPs podem ser avaliados por diferentes métodos moleculares. O objetivo deste estudo foi aperfeiçoar uma metodologia PCR-SSP simples e rápida para a genotipagem de três SNPs de citocinas usando um único teste laboratorial. Para a identificação de IL2-330T/G e IL2+166G/T foram utilizados dois procedimentos na mesma genotipagem, cada um baseado no uso de quatro iniciadores. Para a detecção de TNF-238G/A foram utilizados dois iniciadores que amplificam a guanina e adenina na posição -238. Este estudo permitiu aperfeiçoar um método simples e rápido para identificar três SNPs de citocinas num único teste, podendo ser utilizado em qualquer laboratório de biologia molecular, como alternativa ao uso de kits de alto custo.
ABSTRACT
The analysis of cytokine single nucleotide polymorphisms (SNPs) can be useful in studies of allelic and genotypic frequencies in healthy populations from different regions of Brazil, in association studies of infectious or auto-immune diseases, in anthropological studies and in studies on post-transplant evolution. These SNPs can be assessed by different molecular methods. The objective of this study was to improve a simple and fast methodology, PCR-SSP, for the genotyping of three cytokine SNPs using a single laboratorial test. To identify IL2-330T/G and IL2+166G/T, two procedures were used in the same genotyping assay, each one based on the use of 4 primers. To detect TNF-238G/A, two primers were used that amplify guanine and adenine at position -238. This study enabled the improvement of a simple and fast method for identifying three cytokine SNPs in a single test, which can be adopted in any Molecular Biology laboratory as an alternative to the use of expensive kits.
Texto completo:
DisponíveL
Índice:
LILACS (Américas)
Assunto principal:
Polimorfismo Genético
/
Reação em Cadeia da Polimerase
/
Citocinas
/
Metodologia como Assunto
Tipo de estudo:
Estudo diagnóstico
Limite:
Humanos
Idioma:
Português
Revista:
Rev. bras. hematol. hemoter
Assunto da revista:
Hematologia
Ano de publicação:
2009
Tipo de documento:
Artigo
País de afiliação:
Brasil
Instituição/País de afiliação:
Laboratório de Histocompatibilidade/BR
/
Universidade Estadual de Maringá/BR
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