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Método para mapeamento de locos controladores de características oligogênicas / Genetic mapping of oligogenic traits using maximum likehood functions
Rocha, Rodrigo Barros; Barros, Willian Silva; Muro-Abad, Júpiter Israel; Tomaz, Rafael Simões; Cruz, Cosme Damião; Barros, Everaldo Gonçalves de; Araújo, Elza Fernandes de.
  • Rocha, Rodrigo Barros; Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária. Centro de Pesquisa Agroflorestal de Rondônia. Porto Velho. BR
  • Barros, Willian Silva; Universidade Federal de Pelotas. Departamento de Matemática e Estatística. Pelotas. BR
  • Muro-Abad, Júpiter Israel; Aracruz Celulose. Vitória. BR
  • Tomaz, Rafael Simões; Universidade Federal de Viçosa. Departamento de Biologia Geral. Viçosa. BR
  • Cruz, Cosme Damião; Universidade Federal de Viçosa. Departamento de Biologia Geral. Viçosa. BR
  • Barros, Everaldo Gonçalves de; Universidade Federal de Viçosa. Departamento de Biologia Geral. Viçosa. BR
  • Araújo, Elza Fernandes de; Universidade Federal de Viçosa. Departamento de Biologia Geral. Viçosa. BR
Ciênc. rural ; 40(2): 332-338, fev. 2010. tab, ilus
Artigo em Português | LILACS | ID: lil-539916
RESUMO
Características oligogênicas de distribuição discreta e expressão governada por poucos genes de maior efeito têm se mostrado importantes na condução dos programas de melhoramento, com destaque para a resposta de resistência das plantas às doenças. Métodos tradicionais de detecção de QTL's, que pressupõem normalidade e herança governada por múltiplos fatores, não deveriam ser utilizados para mapeamento dessas características de distribuição discreta e interação epistática predominante. O objetivo deste trabalho é avaliar os resultados de um método para mapeamento e detecção de locos controladores da expressão de características oligogênicas, OTL's (Oligogenic Trait Loci). Esse método, definido como MMCO (Método de Mapeamento de Características Oligogênicas), utiliza funções de verossimilhança para obtenção de estimativas de ligação fatorial entre locos marcadores e locos controladores de características oligogênicas. Os resultados indicam que o método foi adequado para detecção de OTL's em populações F2 relativamente pequenas, compostas por 200 indivíduos, e que a determinação a priori do padrão de herança é condição necessária para a utilização dessa estratégia, que se diferencia por atender as pressuposições de análise, não necessitar de informação prévia de ordenamento entre as marcas e por permitir a obtenção de estimativas a partir da informação contida em todas as classes genotípicas.
ABSTRACT
Oligogenic traits are distinguished by their heritage ruled by higher effect genes and by their importance for cultivated plants, with emphasis to the plant disease resistance inheritance. The qualitative nature and epistatic interaction of these traits results in a heritage pattern that should not be interpreted through traditional QTL detection strategies. The objective of this work was to propose a method for Oligogenic Traits Loci (OTL) detection. This method, defined as Oligogenic Trait Mapping Method (OTMM) uses maximum likehood probability functions to obtain adjusted "r" estimates that express the distance among the molecular markers and the OTL loci. The results show that the method was adequate for OTL detection even in relatively small F2 populations. The prior definition of the oligogenic heritage pattern is one the main requirements of this method that focus in the attainment of the analysis presumptions without previous markers order information.

Texto completo: DisponíveL Índice: LILACS (Américas) Tipo de estudo: Pesquisa qualitativa Idioma: Português Revista: Ciênc. rural Assunto da revista: Ciência / Saúde Ambiental Ano de publicação: 2010 Tipo de documento: Artigo País de afiliação: Brasil Instituição/País de afiliação: Aracruz Celulose/BR / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária/BR / Universidade Federal de Pelotas/BR / Universidade Federal de Viçosa/BR

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