Study of the dynamic of rotavirus circulation by identification of their electropherotypes / Estudo da dinâmica de circulação de rotavírus através da identificação de seus eletroferótipos eletroferótipos

ABSTRACT

An electrophoretical study of rotavirus strains was carried out to determine the RNA migration pattern sand to follow the dynamics of virus circulation. Fifty five positive fecal samples for rotavirus, obtained from 0-5 year old children during 2005 and 2006, were subjected to the Polyacrylamide Gel Electrophoresis. It was possible to define the RNA migration pattern of 37 (62%) rotavirus strains, displaying eight distinct profiles, all of them compatible with group A rotavirus. All rotavirus were detected from May to September showing an outstanding seasonality. In 2005 were detected only rotavirus strains presenting long migration patterns (100%=15/15), named L1, L2, L3 or L4. The L2 profile was predominant. However, in 2006, a few rotavirus strains displaying long migration patterns (L1 and L2) were detected (14%=3/22) from May to June, although rotavirus strains presenting short migration patterns (S1, S2, S3 or S4) were detected between Julyand August. These viruses of short RNA migration patterns were the most predominant strains (86%=19/22). The variability of RNA migration patterns detected showed a great genomic heterogeneity of rotavirus strains. By monitoring viral nucleic acid electrophoretic characteristics was possible to follow the dynamics of rotavirus circulation between 2005 and 2006.

RESUMO

Foi realizado um estudo eletroforético de amostras de rotavírus, visando determinar os perfis de migração do RNA viral, bem como acompanhar a dinâmica da circulação dos mesmos. Para tanto, 55 amostras fecais diarréicas, positivas para rotavírus, obtidas de crianças de 0-5 anos, durante os anos de 2005 e 2006, foram submetidas à técnica de eletroforese em gel de poliacrilamida. Foi possível definir o perfil eletroforético de 37 (62%) delas, tendo sido observados oito perfis distintos, todos compatíveis com rotavírus do grupo A. Todas as amostras de rotavírus foram detectadas de maio a setembro, indicando uma sazonalidade na ocorrência destas infecções em Juiz de Fora. Em 2005 todas as amostras apresentaram perfis longos (100%=15/15), denominados de L1 a L4, com predominância de amostras de perfil L2. Em 2006, poucas amostras de perfil longo (14%=3/22) foram detectadas nos meses de maio e junho, tendo sido substituídas pelas amostras de perfil curto (C1-C4), que emergiram em julho, predominando neste ano (86%=19/22). A variabilidade dos perfis eletroforéticos detectados mostrou uma grande heterogeneidade genômica e através do monitoramento foi possível acompanhar a dinâmica de circulação das amostras de rotavírus entre 2005 e 2006.