Molecular characterization of Salmonella strains in individuals with acute diarrhea syndrome in the State of Sucre, Venezuela / Caracterização molecular de cepas de Salmonella em indivíduos com síndrome da diarreia aguda no Estado de Sucre, Venezuela

ABSTRACT

INTRODUCTION:In Venezuela, acute diarrheic syndrome (ADS) is a primary cause of morbi-mortality, often involving the Salmonella genus. Salmonella infections are associated with acute gastroenteritis, one of the most common alimentary intoxications, and caused by the consumption of contaminated water and food, especially meat. METHODS: Conventional and molecular methods were used to detect Salmonella strains from 330 fecal samples from individuals of different ages and both sexes with ADS. Polymerase chain reaction (PCR) was used for the molecular characterization of Salmonella, using invA, sefA, and fliC genes for the identification of this genus and the serotypes Enteritidis and Typhimurium, respectively. RESULTS: The highest frequency of individuals with ADS was found in children 0-2 years old (39.4%), and the overall frequency of positive coprocultures was 76.9%. A total of 14 (4.2%) strains were biochemically and immunologically identified as Salmonella enterica subsp. enterica, of which 7 were classified as belonging to the Enteritidis serotype, 4 to the Typhimurium serotype, and 3 to other serotypes. The S. enterica strains were distributed more frequently in the age groups 3-4 and 9-10 years old. CONCLUSIONS: The molecular characterization method used proved to be highly specific for the typing of S. enterica strains using DNA extracted from both the isolated colonies and selective enrichment broths directly inoculated with fecal samples, thus representing a complementary tool for the detection and identification of ADS-causing bacteria.

RESUMO

INTRODUÇÃO: Na Venezuela, síndrome da diarreia aguda (SDA) é a principal causa de mórbi-mortalidade, muitas vezes envolvem o gênero Salmonella. Infecções por Salmonella são associadas com gastroenterite aguda, uma das mais comuns intoxicações alimentares causada pelo consumo de água e alimentos contaminados, principalmente carne. MÉTODOS: Métodos convencionais e moleculares foram usados para detectar cepas de Salmonella em 330 amostras de fezes de indivíduos com SDA de diferentes idades e ambos os sexos. A reação em cadeia da polimerase (PCR) foi utilizada para a caracterização molecular de genes Salmonella invA, sefA e fliC para identificar o gênero e os sorotipos Enteritidis e Typhimurium, respectivamente. RESULTADOS: A maior frequência de indivíduos com SDA foi encontrada em crianças de 0-2 (39,4%) anos, e a frequência total de culturas de fezes positiva foi de 76,9%. Um total de 14 (4,2%) cepas foram bioquímica e imunologicamente identificados como Salmonella enterica subsp. enterica, dos quais 7 foram classificados como pertencentes ao sorotipo Enteritidis, Typhimurium sorotipo 4 e 3 para outros sorotipos. Cepas S. enterica foram distribuídas mais frequentemente em grupos de 3-4 e 9-10 anos de idade. CONCLUSÕES: O método de caracterização molecular usada provou ser altamente específico para tipificar as estirpes dos S. enterica usando tanto DNA extraído de colônias isoladas e direta e caldos de enriquecimento seletivo inoculados com amostras fecais, o que representa uma ferramenta complementar para a detecção e identificação de bactérias que causam a SDA.