Asociación entre marcadores moleculares localizados en 4q y fisura labiopalatina no sindrómica en población chilena / Association between molecular markers located in 4q and fissure labiopalatina not sindrómica in Chilean population

RESUMEN

El objetivo de la presente investigación fue probar la posible asociación de uno o más microsatélites localizados en 4q25-4q33 y FLPNS. Se analizó una muestra de 51 genealogías extensas. A partir de estas genealogías se obtuvieron 51 tríos caso-progenitores, que se estudiaron con el programa extended transmisión disequilibrium test (ETDT). Además se colectó a 51 probandos y 94 controles para un estudio caso-control en población chilena y se postuló comprobar las diferencias entre ambos estudios de asociación. Se analizaron los microsatélites D4S1570, D4S1615, FGA, UCP1 y D4S1597 ubicados en 4q, utilizándose la técnica de la polimerasa en cadena (PCR) para el análisis de ADN, marcandose la hebra líder con un fluorocromo. Los resultados electroforeticos fueron analizados en un secuenciador automático ABIPRISM 377. Observándose que FGA en el grupo control y FGA, D4S1570 y D4S1597 en los pacientes estaban en equilibrio de H-W. Estos resultados implican que un estudio caso-control no es adecuado para el estudio de estos marcadores. Para obviar este problema se utilizó el programa ETDT, observándose que los microsatélites D4S1570, UCP1 y D4S1597 presentaron una asociación tipo alélica en familias multiples. Estos resultados sugiere que estos microsatélites se encontrarían cerca de 1 o más genes candidatos de esta malformación en la región eq24-4q31.

ABSTRACT

The objective of this investigation is to test the hypothesis of the possible association of one or more microsatellites located on 4q25-4q33 with NSCLP. In this study a sample of 51 extended pedigrees were analyzed. From these pedigrees a sample of 51 case-parents trios was obtained. A novel genetic analysis was carried out using the Extended Transmission Disequilibrium Test (ETDT). Also a case control study was carried out with the 51 probands of the case-parents trios plus a sample of 94 controls of the Chilean population to test if differences were observed resulting from the methods used for the association studies. Microsatellites D4S1570, D4S1615, FGA, UCPI and D4S1597 located in 4q were analyzed. The polymerase chain reaction (PCR) was used for analysis of DNA. Forward primers were marked with fluorescent-dye-Iabel. Electrophoresis and analyses were carried out in an ABI PRISM 377 automatic sequencer. In the case-control study, only FGA was in H-W equilibrium in controls, whereas FGA, D4S1570 y D4S1597 were in H-W equilibrium in cases. These results imply that a case control study does not represent an adequate procedure to carry out an association study between the aforementioned micro satellites and NSCLP. In order to obviate this problem the ETDT program was used. From all of the analyzed microsatellites, D4S1570, UCPl and D4S 1597 presented significant allele wise association in those case-parents trios to multiplex families. This result suggests that these microsatellites would be located close to one or more candidate genes for this malformation in 4q24-4q31.