Drug resistance and molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis in Mexico: a systematic review / Farmacorresistencia y epidemiología molecular de Mycobacterium tuberculosis en México: una revisión sistemática

ABSTRACT

Objective. To compare drug resistance (DR) rates and genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis strains from different states of Mexico. Materials and methods. A systematic review of English and Spanish-language articles using MEDLINE and Google Scholar. Search terms included Mycobacterium tuberculosis, Mexico, resistance, mutation and epidemiology. Results. Fifteen studies for phenotypic DR rates (n=2 694), twelve studies for genotypic DR (n=748) and eleven studies for genetic diversity (n=2 044) met our inclusion criteria. Mean DR and multidrug resistance (MDR) rates were 37.5% and 20.6%, respectively. The most frequent mutations were rpoB531 (53.1%), katG315 (50.6%), embB306 (32.1%), rpsL43 (14.6%) and pncA359 (16.7%) in DR strains. Novel mutations were found. Predominant shared types were SIT53 (T1, n=188, 3.9%), SIT119 (X1, n=125, 6.9%), SIT19 (EAI2-Manila, n=80, 6.3%) and SIT42 (LAM9, n=77, 3.0%). SIT1 Beijing genotype has been reported in six states from Mexico. Conclusions. DR and MDR rates continue to increase. Genetic diversity of M. tuberculosis strains in Mexico is high. Reports of Beijing strains are increasing.

RESUMEN

Objetivo. Comparar los niveles de farmacorresistencia (FR) y la diversidad genética de cepas de Mycobacterium tuberculosis de diferentes estados de México. Material y métodos. Una revisión sistemática de artículos en inglés y español usando MEDLINE y Google Scholar. Los términos de búsqueda incluyeron Mycobacterium tuberculosis, México, resistencia, mutación y epidemiología. Resultados. Quince estudios de niveles de FR fenotípica (n=2 694), doce estudios de FR genotípica (n=748) y once estudios de diversidad genética (n=2 044) concordaron con nuestros criterios de inclusión. El promedio de los niveles de FR y multifarmacorresistencia (MFR) fue 37.5 y 20.6%, respectivamente. Las mutaciones más frecuentes fueron rpoB531 (53.1%), katG315 (50.6%), embB306 (32.1%), rpsL43 (14.6%) y pncA359 (16.7%) en cepas FR. Se encontraron nuevas mutaciones. Los tipos compartidos predominantes fueron SIT53 (T1, n=188, 3.9%), SIT119 (X1, n=125, 6.9%), SIT19 (EAI2-Manila, n=80, 6.3%) y SIT42 (LAM9, n=77, 3.0%). El genotipo Beijing SIT1 se ha reportado en seis estados de México. Conclusiones. Las tasas de FR y MFR siguen incrementando. La diversidad genética de las cepas de M. tuberculosis es alta. Los reportes de cepas Beijing están aumentando.