Identificação e análise filogenética de espécies do gênero Sporothrix isoladas em área endêmica de esporotricose no Estado do Rio de Janeiro / Identification and phylogenetic analysis of species of the Genus Sporothrix from endemic are of sporothrichosis in the Rio de Janeiro State

RESUMO

A esporotricose, micose subcutânea causada pelo complexo Sporothrix schenckii, é cosmopolita e a mais freqüente na América Latina. Nos últimos anos tem aumentado significativamente o número de casos no Brasil, com destaque para o aumento no Estado do Rio de Janeiro na última década. Recentemente, foram consideradas quatro novas espécies dentro do gênero Sporothrix, sendo essas Sporothrix brasiliensis, S. globosa, S. mexicana e S. luriei. Entretanto somente 25 isolados de área endêmica no Rio de Janeiro foram incluídos nos estudos prévios. A caracterização destas foi realizada por meio da utilização de provas fenotípicas morfologia de conídios, teste de crescimento à 30ºC, teste de termotolerância e auxonograma. No presente trabalho realizamos a caracterização de 248 isolados oriundos de pacientes atendidos no ambulatório de Dermatologia do IPEC, os quais tiveram diagnóstico de esporotricose durante a epidemia de esporotricose, no período de 1998 e 2008. De acordo com as características fenotípicas, 206 isolados (83,1 porcento) foram caracterizados como S. brasiliensis, um isolado (0,4 porcento) como S. mexicana, 15 (6,0 porcento) como S. schenckii e em 26 isolados (10,5 porcento) não foi possível realizar a caracterização da espécie sendo classificadas como Sporothrix sppDentre esse isolados foi realizada a análise molecular de 8 (31 porcento) isolados que apresentaram resultados inconclusivos nos estudos fenotípicos através do sequenciamento de um locus do gene calmodulina possibilitou a formação de um grande grupo constituído por 7 isolados todos caracterizados genotipicamente como pertencentes à espécie S. brasiliensis. A análise em nível de genótipo deve ser utilizada como ferramenta complementar na identificação de espécies do complexo Sporothrix. A correlação entre dados moleculares e características fenotípicas é fundamental na identificação de espécies complexo Sporothrix, possibilitando a implementação da taxonomia polifásica.

ABSTRACT

Sporothrix schenckii is the species responsible for sporotrichosis, an important subcutaneous mycosis with a worldwide distribution, and very frequent in Latin America, and it has been reported as endemic in Rio de Janeiro, Brazil. Recent molecular studies have demonstrated that this species constitutes a complex of numerous phylogenetic species, which were phenotipically characterized using different culture media, growth rates at different temperatures, and nutritional tests as well comparison calmodulin genes and it was proposed four new species Sporothrix brasiliensis, Sporothrix globosa, Sporothrix mexicana and Sporothrix luriei. And just 25 isolates from the endemic occurring in Rio de Janeiro were included in this previous study. We have studied a total of 248 Sporothrix isolates from this endemic obtained during the period of 1998 and 2008. The phenotypic characterization was based on the morphology of conidia, growth rates at 30ºC and 37 ºC, ability to grow at 37 ºC, and auxonographic method. According to the key features for species differentiation, 206 isolates (83.1 percent) were characterized as S. brasiliensis, one as S. mexicana (0.4 percent), 15 (6.0 percent) as S. schenckii and in 26 isolates (10.5 percent) the species was not differentiated being classified as Sporothrix spp. Among 8 (31 percent) of these unidentified isolates, molecular methodology, by sequence analysis of on protein coding locus (calmodulin) was performed, revealing the presence of one major clade, grouping 7 of these isolates with S. brasiliensis, representing this phylogenetic species. The analysis in genotype level should be used as complemental tool in the identification of species of the Sporothrix complex. The correlation among molecular data and phenotipe is fundamental in the identification of species Sporothrix complex, making possible the implementation of the polyphasic taxonomy.