An automated annotation tool for genomic DNA sequences using GeneScan and BLAST.

Lynn, A M; Jain, C K; Kosalai, K; Barman, P; Thakur, N; Batra, H; Bhattacharya, A

Lynn, A M; Jain, C K; Kosalai, K; Barman, P; Thakur, N; Batra, H; Bhattacharya, A.

J Genet ; 2001 Apr; 80(1): 9-16

Artigo em Inglês | IMSEAR | ID: sea-114357

ABSTRACT

ABSTRACT

Genomic sequence data are often available well before the annotated sequence is published. We present a method for analysis of genomic DNA to identify coding sequences using the GeneScan algorithm and characterize these resultant sequences by BLAST. The routines are used to develop a system for automated annotation of genome DNA sequences.

Assuntos

Algoritmos; Animais; Células Eucarióticas; Evolução Molecular; Análise de Fourier; Genética Microbiana; Genômica; Plasmodium falciparum/genética; Análise de Sequência de DNA; Software

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Texto completo: DisponíveL Índice: IMSEAR (Sudeste Asiático) Assunto principal: Plasmodium falciparum / Algoritmos / Software / Análise de Sequência de DNA / Evolução Molecular / Genômica / Células Eucarióticas / Análise de Fourier / Genética Microbiana / Animais Idioma: Inglês Revista: J Genet Ano de publicação: 2001 Tipo de documento: Artigo

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