Your browser doesn't support javascript.
Show: 20 | 50 | 100
Results 1 - 3 de 3
Filter
Add filters

Type of study
Language
Year range
1.
Tegally, H.; San, J. E.; Cotten, M.; Moir, M.; Tegomoh, B.; Mboowa, G.; Martin, D. P.; Baxter, C.; Lambisia, A. W.; Diallo, A.; Amoako, D. G.; Diagne, M. M.; Sisay, A.; Zekri, A. N.; Gueye, A. S.; Sangare, A. K.; Ouedraogo, A. S.; Sow, A.; Musa, A. O.; Sesay, A. K.; Abias, A. G.; Elzagheid, A. I.; Lagare, A.; Kemi, A. S.; Abar, A. E.; Johnson, A. A.; Fowotade, A.; Oluwapelumi, A. O.; Amuri, A. A.; Juru, A.; Kandeil, A.; Mostafa, A.; Rebai, A.; Sayed, A.; Kazeem, A.; Balde, A.; Christoffels, A.; Trotter, A. J.; Campbell, A.; Keita, A. K.; Kone, A.; Bouzid, A.; Souissi, A.; Agweyu, A.; Naguib, A.; Gutierrez, A. V.; Nkeshimana, A.; Page, A. J.; Yadouleton, A.; Vinze, A.; Happi, A. N.; Chouikha, A.; Iranzadeh, A.; Maharaj, A.; Batchi-Bouyou, A. L.; Ismail, A.; Sylverken, A. A.; Goba, A.; Femi, A.; Sijuwola, A. E.; Marycelin, B.; Salako, B. L.; Oderinde, B. S.; Bolajoko, B.; Diarra, B.; Herring, B. L.; Tsofa, B.; Lekana-Douki, B.; Mvula, B.; Njanpop-Lafourcade, B. M.; Marondera, B. T.; Khaireh, B. A.; Kouriba, B.; Adu, B.; Pool, B.; McInnis, B.; Brook, C.; Williamson, C.; Nduwimana, C.; Anscombe, C.; Pratt, C. B.; Scheepers, C.; Akoua-Koffi, C. G.; Agoti, C. N.; Mapanguy, C. M.; Loucoubar, C.; Onwuamah, C. K.; Ihekweazu, C.; Malaka, C. N.; Peyrefitte, C.; Grace, C.; Omoruyi, C. E.; Rafaï, C. D.; Morang'a, C. M.; Erameh, C.; Lule, D. B.; Bridges, D. J.; Mukadi-Bamuleka, D.; Park, D.; Rasmussen, D. A.; Baker, D.; Nokes, D. J.; Ssemwanga, D.; Tshiabuila, D.; Amuzu, D. S. Y.; Goedhals, D.; Grant, D. S.; Omuoyo, D. O.; Maruapula, D.; Wanjohi, D. W.; Foster-Nyarko, E.; Lusamaki, E. K.; Simulundu, E.; Ong'era, E. M.; Ngabana, E. N.; Abworo, E. O.; Otieno, E.; Shumba, E.; Barasa, E.; Ahmed, E. B.; Ahmed, E. A.; Lokilo, E.; Mukantwari, E.; Philomena, E.; Belarbi, E.; Simon-Loriere, E.; Anoh, E. A.; Manuel, E.; Leendertz, F.; Taweh, F. M.; Wasfi, F.; Abdelmoula, F.; Takawira, F. T.; Derrar, F.; Ajogbasile, F. V.; Treurnicht, F.; Onikepe, F.; Ntoumi, F.; Muyembe, F. M.; Ragomzingba, F. E. Z.; Dratibi, F. A.; Iyanu, F. A.; Mbunsu, G. K.; Thilliez, G.; Kay, G. L.; Akpede, G. O.; van Zyl, G. U.; Awandare, G. A.; Kpeli, G. S.; Schubert, G.; Maphalala, G. P.; Ranaivoson, H. C.; Omunakwe, H. E.; Onywera, H.; Abe, H.; Karray, H.; Nansumba, H.; Triki, H.; Kadjo, H. A. A.; Elgahzaly, H.; Gumbo, H.; Mathieu, H.; Kavunga-Membo, H.; Smeti, I.; Olawoye, I. B.; Adetifa, I. M. O.; Odia, I.; Ben Boubaker, I. B.; Mohammad, I. A.; Ssewanyana, I.; Wurie, I.; Konstantinus, I. S.; Halatoko, J. W. A.; Ayei, J.; Sonoo, J.; Makangara, J. C.; Tamfum, J. M.; Heraud, J. M.; Shaffer, J. G.; Giandhari, J.; Musyoki, J.; Nkurunziza, J.; Uwanibe, J. N.; Bhiman, J. N.; Yasuda, J.; Morais, J.; Kiconco, J.; Sandi, J. D.; Huddleston, J.; Odoom, J. K.; Morobe, J. M.; Gyapong, J. O.; Kayiwa, J. T.; Okolie, J. C.; Xavier, J. S.; Gyamfi, J.; Wamala, J. F.; Bonney, J. H. K.; Nyandwi, J.; Everatt, J.; Nakaseegu, J.; Ngoi, J. M.; Namulondo, J.; Oguzie, J. U.; Andeko, J. C.; Lutwama, J. J.; Mogga, J. J. H.; O'Grady, J.; Siddle, K. J.; Victoir, K.; Adeyemi, K. T.; Tumedi, K. A.; Carvalho, K. S.; Mohammed, K. S.; Dellagi, K.; Musonda, K. G.; Duedu, K. O.; Fki-Berrajah, L.; Singh, L.; Kepler, L. M.; Biscornet, L.; de Oliveira Martins, L.; Chabuka, L.; Olubayo, L.; Ojok, L. D.; Deng, L. L.; Ochola-Oyier, L. I.; Tyers, L.; Mine, M.; Ramuth, M.; Mastouri, M.; ElHefnawi, M.; Mbanne, M.; Matsheka, M. I.; Kebabonye, M.; Diop, M.; Momoh, M.; Lima Mendonça, M. D. L.; Venter, M.; Paye, M. F.; Faye, M.; Nyaga, M. M.; Mareka, M.; Damaris, M. M.; Mburu, M. W.; Mpina, M. G.; Owusu, M.; Wiley, M. R.; Tatfeng, M. Y.; Ayekaba, M. O.; Abouelhoda, M.; Beloufa, M. A.; Seadawy, M. G.; Khalifa, M. K.; Matobo, M. M.; Kane, M.; Salou, M.; Mbulawa, M. B.; Mwenda, M.; Allam, M.; Phan, M. V. T.; Abid, N.; Rujeni, N.; Abuzaid, N.; Ismael, N.; Elguindy, N.; Top, N. M.; Dia, N.; Mabunda, N.; Hsiao, N. Y.; Silochi, N. B.; Francisco, N. M.; Saasa, N.; Bbosa, N.; Murunga, N.; Gumede, N.; Wolter, N.; Sitharam, N.; Ndodo, N.; Ajayi, N. A.; Tordo, N.; Mbhele, N.; Razanajatovo, N. H.; Iguosadolo, N.; Mba, N.; Kingsley, O. C.; Sylvanus, O.; Femi, O.; Adewumi, O. M.; Testimony, O.; Ogunsanya, O. A.; Fakayode, O.; Ogah, O. E.; Oludayo, O. E.; Faye, O.; Smith-Lawrence, P.; Ondoa, P.; Combe, P.; Nabisubi, P.; Semanda, P.; Oluniyi, P. E.; Arnaldo, P.; Quashie, P. K.; Okokhere, P. O.; Bejon, P.; Dussart, P.; Bester, P. A.; Mbala, P. K.; Kaleebu, P.; Abechi, P.; El-Shesheny, R.; Joseph, R.; Aziz, R. K.; Essomba, R. G.; Ayivor-Djanie, R.; Njouom, R.; Phillips, R. O.; Gorman, R.; Kingsley, R. A.; Neto Rodrigues, Rmdesa, Audu, R. A.; Carr, R. A. A.; Gargouri, S.; Masmoudi, S.; Bootsma, S.; Sankhe, S.; Mohamed, S. I.; Femi, S.; Mhalla, S.; Hosch, S.; Kassim, S. K.; Metha, S.; Trabelsi, S.; Agwa, S. H.; Mwangi, S. W.; Doumbia, S.; Makiala-Mandanda, S.; Aryeetey, S.; Ahmed, S. S.; Ahmed, S. M.; Elhamoumi, S.; Moyo, S.; Lutucuta, S.; Gaseitsiwe, S.; Jalloh, S.; Andriamandimby, S. F.; Oguntope, S.; Grayo, S.; Lekana-Douki, S.; Prosolek, S.; Ouangraoua, S.; van Wyk, S.; Schaffner, S. F.; Kanyerezi, S.; Ahuka-Mundeke, S.; Rudder, S.; Pillay, S.; Nabadda, S.; Behillil, S.; Budiaki, S. L.; van der Werf, S.; Mashe, T.; Mohale, T.; Le-Viet, T.; Velavan, T. P.; Schindler, T.; Maponga, T. G.; Bedford, T.; Anyaneji, U. J.; Chinedu, U.; Ramphal, U.; George, U. E.; Enouf, V.; Nene, V.; Gorova, V.; Roshdy, W. H.; Karim, W. A.; Ampofo, W. K.; Preiser, W.; Choga, W. T.; Ahmed, Y. A.; Ramphal, Y.; Bediako, Y.; Naidoo, Y.; Butera, Y.; de Laurent, Z. R.; Ouma, A. E. O.; von Gottberg, A.; Githinji, G.; Moeti, M.; Tomori, O.; Sabeti, P. C.; Sall, A. A.; Oyola, S. O.; Tebeje, Y. K.; Tessema, S. K.; de Oliveira, T.; Happi, C.; Lessells, R.; Nkengasong, J.; Wilkinson, E..
Science ; : eabq5358, 2022.
Article in English | PubMed | ID: covidwho-2029459

ABSTRACT

Investment in SARS-CoV-2 sequencing in Africa over the past year has led to a major increase in the number of sequences generated, now exceeding 100,000 genomes, used to track the pandemic on the continent. Our results show an increase in the number of African countries able to sequence domestically, and highlight that local sequencing enables faster turnaround time and more regular routine surveillance. Despite limitations of low testing proportions, findings from this genomic surveillance study underscore the heterogeneous nature of the pandemic and shed light on the distinct dispersal dynamics of Variants of Concern, particularly Alpha, Beta, Delta, and Omicron, on the continent. Sustained investment for diagnostics and genomic surveillance in Africa is needed as the virus continues to evolve, while the continent faces many emerging and re-emerging infectious disease threats. These investments are crucial for pandemic preparedness and response and will serve the health of the continent well into the 21st century.

2.
Embase;
Preprint in English | EMBASE | ID: ppcovidwho-326897

ABSTRACT

The severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) epidemic in southern Africa has been characterised by three distinct waves. The first was associated with a mix of SARS-CoV-2 lineages, whilst the second and third waves were driven by the Beta and Delta variants respectively1–3. In November 2021, genomic surveillance teams in South Africa and Botswana detected a new SARS-CoV-2 variant associated with a rapid resurgence of infections in Gauteng Province, South Africa. Within three days of the first genome being uploaded, it was designated a variant of concern (Omicron) by the World Health Organization and, within three weeks, had been identified in 87 countries. The Omicron variant is exceptional for carrying over 30 mutations in the spike glycoprotein, predicted to influence antibody neutralization and spike function4. Here, we describe the genomic profile and early transmission dynamics of Omicron, highlighting the rapid spread in regions with high levels of population immunity.

SELECTION OF CITATIONS
SEARCH DETAIL