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Sponge Whirl-Pak Sampling Method and Droplet Digital RT-PCR Assay for Monitoring of SARS-CoV-2 on Surfaces in Public and Working Environments.
Cardinale, Davide; Tafuro, Maria; Mancusi, Andrea; Girardi, Santa; Capuano, Federico; Proroga, Yolande Thérèse Rose; Corrado, Federica; D'Auria, Jacopo Luigi; Coppola, Annachiara; Rofrano, Giuseppe; Volzone, Palmiero; Galdi, Pio; De Vita, Sabato; Gallo, Alfonso; Suffredini, Elisabetta; Pierri, Biancamaria; Cerino, Pellegrino; Morgante, Maria.
  • Cardinale D; Centro di Referenza Nazionale per l'Analisi e Studio di Correlazione tra Ambiente, Animale e Uomo, Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno, Via Salute n. 2, 80055 Portici, Italy.
  • Tafuro M; Centro di Referenza Nazionale per l'Analisi e Studio di Correlazione tra Ambiente, Animale e Uomo, Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno, Via Salute n. 2, 80055 Portici, Italy.
  • Mancusi A; Department of Food Security Coordination, Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno, Via Salute n. 2, 80055 Portici, Italy.
  • Girardi S; Department of Food Security Coordination, Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno, Via Salute n. 2, 80055 Portici, Italy.
  • Capuano F; Department of Food Security Coordination, Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno, Via Salute n. 2, 80055 Portici, Italy.
  • Proroga YTR; Department of Food Security Coordination, Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno, Via Salute n. 2, 80055 Portici, Italy.
  • Corrado F; Centro di Referenza Nazionale per l'Analisi e Studio di Correlazione tra Ambiente, Animale e Uomo, Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno, Via Salute n. 2, 80055 Portici, Italy.
  • D'Auria JL; Centro di Referenza Nazionale per l'Analisi e Studio di Correlazione tra Ambiente, Animale e Uomo, Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno, Via Salute n. 2, 80055 Portici, Italy.
  • Coppola A; Centro di Referenza Nazionale per l'Analisi e Studio di Correlazione tra Ambiente, Animale e Uomo, Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno, Via Salute n. 2, 80055 Portici, Italy.
  • Rofrano G; Centro di Referenza Nazionale per l'Analisi e Studio di Correlazione tra Ambiente, Animale e Uomo, Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno, Via Salute n. 2, 80055 Portici, Italy.
  • Volzone P; Centro di Referenza Nazionale per l'Analisi e Studio di Correlazione tra Ambiente, Animale e Uomo, Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno, Via Salute n. 2, 80055 Portici, Italy.
  • Galdi P; Centro di Referenza Nazionale per l'Analisi e Studio di Correlazione tra Ambiente, Animale e Uomo, Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno, Via Salute n. 2, 80055 Portici, Italy.
  • De Vita S; Centro di Referenza Nazionale per l'Analisi e Studio di Correlazione tra Ambiente, Animale e Uomo, Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno, Via Salute n. 2, 80055 Portici, Italy.
  • Gallo A; Centro di Referenza Nazionale per l'Analisi e Studio di Correlazione tra Ambiente, Animale e Uomo, Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno, Via Salute n. 2, 80055 Portici, Italy.
  • Suffredini E; Department of Food Safety, Nutrition and Veterinary Public Health, Istituto Superiore di Sanità, Viale Regina Elena, 299, 00161 Rome, Italy.
  • Pierri B; Centro di Referenza Nazionale per l'Analisi e Studio di Correlazione tra Ambiente, Animale e Uomo, Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno, Via Salute n. 2, 80055 Portici, Italy.
  • Cerino P; Centro di Referenza Nazionale per l'Analisi e Studio di Correlazione tra Ambiente, Animale e Uomo, Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno, Via Salute n. 2, 80055 Portici, Italy.
  • Morgante M; Azienda Sanitaria Locale Avellino, 83100 Avellino, Italy.
Int J Environ Res Public Health ; 19(10)2022 05 11.
Article in English | MEDLINE | ID: covidwho-1847333
ABSTRACT
The SARS-CoV-2 can spread directly via saliva, respiratory aerosols and droplets, and indirectly by contact through contaminated objects and/or surfaces and by air. In the context of COVID-19 fomites can be an important vehicle of virus transmission and contribute to infection risk in public environments. The aim of the study was to analyze through surface sampling (sponge method) the presence of SARS-CoV-2 in public and working environments, in order to evaluate the risk for virus transmission. Seventy-seven environmental samples were taken using sterile sponges in 17 animal farms, 4 public transport buses, 1 supermarket and 1 hotel receptive structure. Furthermore, 246 and 93 swab samples were taken in the farms from animals and from workers, respectively. SARS-CoV-2 detection was conducted by real-time RT-PCR and by digital droplet RT-PCR (dd RT-PCR) using RdRp, gene E and gene N as targets. None of the human and animal swab samples were positive for SARS-CoV-2, while detection was achieved in 20 of the 77 sponge samples (26%) using dd RT-PCR. Traces of the RdRp gene, gene E and gene N were found in 17/77 samples (22%, average concentration 31.2 g.c./cm2, range 5.6 to 132 g.c./cm2), 8/77 samples (10%, average concentration 15.1 g.c./cm2, range 6 to 36 g.c./cm2), and in 1/77 (1%, concentration 7.2 g.c./cm2). Higher detection rates were associated with sampling in animal farms and on public transport buses (32% and 30%) compared to the supermarket (21%) and the hotel (no detection). The result of the study suggests that the risk of contamination of surfaces with SARS-CoV-2 increases in environments in which sanitation strategies are not suitable and/or in highly frequented locations, such as public transportation. Considering the analytical methods, the dd RT-PCR was the only approach achieving detection of SARS-CoV-2 traces in environmental samples. Thus, dd RT-PCR emerges as a reliable tool for sensitive SARS-CoV-2 detection.
Subject(s)
Keywords

Full text: Available Collection: International databases Database: MEDLINE Main subject: SARS-CoV-2 / COVID-19 Type of study: Diagnostic study / Experimental Studies / Observational study / Prognostic study Limits: Animals Language: English Year: 2022 Document Type: Article Affiliation country: Ijerph19105861

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Full text: Available Collection: International databases Database: MEDLINE Main subject: SARS-CoV-2 / COVID-19 Type of study: Diagnostic study / Experimental Studies / Observational study / Prognostic study Limits: Animals Language: English Year: 2022 Document Type: Article Affiliation country: Ijerph19105861