Concordance de la détection des virus respiratoires sur écouvillonnage nasopharyngé et lavage broncho-alvéolaire chez l'adulte admis pour une suspicion de pneumonie

ABSTRACT

Introduction A ce jour, peu de données sont disponibles sur la concordance de la détection des virus respiratoires (en dehors du SARS-CoV2) entre le prélèvement nasopharyngé (NP) et le lavage broncho-alvéolaire (LBA) chez l'adulte. L'objectif de cette étude était de décrire la concordance de leurs résultats. Matériels et méthodes Une analyse rétrospective monocentrique a été réalisée à l'aide des données de 276 adultes suspects de pneumonie et testés par PCR multiplex dans le NP et le LBA à 24 heures d'intervalle. Résultats Les patients étaient majoritairement des hommes (65 %), avec un âge médian de 60 ans[IQR  50,9-67,8]. 169 patients (61 %) ont été admis en réanimation Nous avons détecté au moins un virus respiratoire dans 95 NP (34 %) et dans 80 BAL (29 %). Comparé au LBA, le NP avait une sensibilité de 71,6 % et une spécificité de 93,4 % et un coefficient Kappa de 0,67. Le même agent pathogène ou combinaison d'agents pathogènes a été observé chez 84 % des patients positifs à la fois sur le NP et le LBA. La grippe B, le parainfluenza, les coronavirus HKU1, NL63, 229E présentaient la concordance la plus élevée (100 %) entre le NP et la LBA, tandis que le coronavirus OC43 et le rhinovirus présentaient la concordance la plus faible (33 % et 67 %, respectivement).Nous avons observé que les patients atteints d'une maladie respiratoire chronique ont une plus faible concordance entre le NP et LBA avec un OR ajusté à 0,5, IC 95 % (0,25-0,97), p = 0,043. Conclusion Dans ce travai, Il y a une bonne concordance entre le NP et le LBA dans la détection des virus respiratoires chez les patients consultant avec une suspicion de pneumonie. Néanmoins, ces données encouragent toujours à réaliser un LBA lorsque cela est possible afin d'obtenir un diagnostic étiologique plus précis. Aucun lien d'intérêt