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A common variant close to the "tripwire" linker region of NLRP1 contributes to severe COVID-19.
Leal, Vinicius N C; Paulino, Leandro M; Cambui, Raylane A G; Zupelli, Thiago G; Yamada, Suemy M; Oliveira, Leonardo A T; Dutra, Valéria de F; Bub, Carolina B; Sakashita, Araci M; Yokoyama, Ana Paula H; Kutner, José M; Vieira, Camila A; Santiago, Wellyngton M de S; Andrade, Milena M S; Teixeira, Franciane M E; Alberca, Ricardo W; Gozzi-Silva, Sarah C; Yendo, Tatiana M; Netto, Lucas C; Duarte, Alberto J S; Sato, Maria N; Venturini, James; Pontillo, Alessandra.
  • Leal VNC; Laboratório de Imunogenética, Departamento de Imunologia, Instituto de Ciências Biomédicas/ICB, Universidade de São Paulo/USP, São Paulo, SP, Brasil.
  • Paulino LM; Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Mato Grosso do Sul, Campo grande, Mato Grosso do Sul, Brasil.
  • Cambui RAG; Laboratório de Imunogenética, Departamento de Imunologia, Instituto de Ciências Biomédicas/ICB, Universidade de São Paulo/USP, São Paulo, SP, Brasil.
  • Zupelli TG; Laboratório de Imunogenética, Departamento de Imunologia, Instituto de Ciências Biomédicas/ICB, Universidade de São Paulo/USP, São Paulo, SP, Brasil.
  • Yamada SM; Laboratório de Imunogenética, Departamento de Imunologia, Instituto de Ciências Biomédicas/ICB, Universidade de São Paulo/USP, São Paulo, SP, Brasil.
  • Oliveira LAT; Laboratório de Imunogenética, Departamento de Imunologia, Instituto de Ciências Biomédicas/ICB, Universidade de São Paulo/USP, São Paulo, SP, Brasil.
  • Dutra VF; Departamento de Hemoterapia, Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP, Brasil.
  • Bub CB; Departamento de Hemoterapia, Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP, Brasil.
  • Sakashita AM; Departamento de Hemoterapia, Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP, Brasil.
  • Yokoyama APH; Departamento de Hemoterapia, Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP, Brasil.
  • Kutner JM; Departamento de Hemoterapia, Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP, Brasil.
  • Vieira CA; Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Mato Grosso do Sul, Campo grande, Mato Grosso do Sul, Brasil.
  • Santiago WMS; Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Mato Grosso do Sul, Campo grande, Mato Grosso do Sul, Brasil.
  • Andrade MMS; Laboratório de Investigação Médica em Dermatologia e Imunodeficiências (LIM-56, Departamento de Dermatologia, Hospital das Clínicas E Faculdade de Medicina/HCFMUSP, São Paulo, Brasil.
  • Teixeira FME; Laboratório de Investigação Médica em Dermatologia e Imunodeficiências (LIM-56, Departamento de Dermatologia, Hospital das Clínicas E Faculdade de Medicina/HCFMUSP, São Paulo, Brasil.
  • Alberca RW; Laboratório de Investigação Médica em Dermatologia e Imunodeficiências (LIM-56, Departamento de Dermatologia, Hospital das Clínicas E Faculdade de Medicina/HCFMUSP, São Paulo, Brasil.
  • Gozzi-Silva SC; Laboratório de Investigação Médica em Dermatologia e Imunodeficiências (LIM-56, Departamento de Dermatologia, Hospital das Clínicas E Faculdade de Medicina/HCFMUSP, São Paulo, Brasil.
  • Yendo TM; Departamento de Dermatologia, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical, Universidade de São Paulo/FMUSP, São Paulo, Brasil.
  • Netto LC; Unidade Terapia Intensiva, Hospital das Clínicas/FMUSP, São Paulo, Brasil.
  • Duarte AJS; Laboratório de Investigação Médica em Dermatologia e Imunodeficiências (LIM-56, Departamento de Dermatologia, Hospital das Clínicas E Faculdade de Medicina/HCFMUSP, São Paulo, Brasil.
  • Sato MN; Departamento de Patologia, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo/FMUSP, São Paulo, Brasil.
  • Venturini J; Laboratório de Investigação Médica em Dermatologia e Imunodeficiências (LIM-56, Departamento de Dermatologia, Hospital das Clínicas E Faculdade de Medicina/HCFMUSP, São Paulo, Brasil.
  • Pontillo A; Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Mato Grosso do Sul, Campo grande, Mato Grosso do Sul, Brasil.
Inflamm Res ; 2022 Nov 23.
Article in English | MEDLINE | ID: covidwho-2128509
ABSTRACT
OBJECTIVE AND

DESIGN:

The heterogeneity of response to SARS-CoV-2 infection is directly linked to the individual genetic background. Genetic variants of inflammasome-related genes have been pointed as risk factors for several inflammatory sterile and infectious disease. In the group of inflammasome receptors, NLRP1 stands out as a good novel candidate as severity factor for COVID-19 disease.

METHODS:

To address this question, we performed an association study of NLRP1, DPP9, CARD8, IL1B, and IL18 single nucleotide variants (SNVs) in a cohort of 945 COVID-19 patients.

RESULTS:

The NLRP1 p.Leu155His in the linker region, target of viral protease, was significantly associated to COVID-19 severity, which could contribute to the excessive cytokine release reported in severe cases.

CONCLUSION:

Inflammasome genetic background contributes to individual response to SARS-CoV-2.
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Full text: Available Collection: International databases Database: MEDLINE Type of study: Cohort study / Observational study / Prognostic study Topics: Variants Language: English Journal subject: Allergy and Immunology / Pathology Year: 2022 Document Type: Article Affiliation country: S00011-022-01670-3

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