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The turning point of COVID-19 severity is associated with a unique circulating neutrophil gene signature.
Fuzo, Carlos A; Fraga-Silva, Thais F C; Maruyama, Sandra R; Bastos, Víctor A F; Rogerio, Luana A; Takamiya, Nayore T; da Silva-Neto, Pedro V; Pimentel, Vinícius E; Toro, Diana M; Pérez, Malena M; de Carvalho, Jonatan C S; Carmona-Garcia, Ingryd; Oliveira, Camilla N S; Degiovani, Augusto M; Ostini, Fátima M; Constant, Leticia F; de Amorim, Alessandro P; Vilar, Fernando C; Feitosa, Marley R; Parra, Rogerio S; da Rocha, José J R; Feres, Omar; Gaspar, Gilberto G; Viana, Angelina L; Fernandes, Ana P M; Santos, Isabel K F M; Russo, Elisa M S; Cardoso, Cristina R B; Sorgi, Carlos A; Faccioli, Lúcia H; Bonato, Vânia L D; Dias-Baruffi, Marcelo.
  • Fuzo CA; Departamento de Análises Clínicas, Toxicológicas e Bromatológicas, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Fraga-Silva TFC; Departamento de Bioquímica e Imunologia, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Maruyama SR; Departamento de Genética e Evolução, Centro de Ciências Biológicas e da Saúde, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, São Paulo, Brazil.
  • Bastos VAF; Departamento de Análises Clínicas, Toxicológicas e Bromatológicas, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Rogerio LA; Departamento de Genética e Evolução, Centro de Ciências Biológicas e da Saúde, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, São Paulo, Brazil.
  • Takamiya NT; Departamento de Genética e Evolução, Centro de Ciências Biológicas e da Saúde, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, São Paulo, Brazil.
  • da Silva-Neto PV; Departamento de Análises Clínicas, Toxicológicas e Bromatológicas, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Pimentel VE; Programa de Pós-Graduação em Biociências e Biotecnologia Aplicadas à Farmácia, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Toro DM; Programa de Pós-Graduação em Imunologia Básica e Aplicada, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Amazonas, Manaus, Amazonas, Brazil.
  • Pérez MM; Departamento de Análises Clínicas, Toxicológicas e Bromatológicas, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • de Carvalho JCS; Programa de Pós-Graduação em Imunologia Básica e Aplicada, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Carmona-Garcia I; Departamento de Análises Clínicas, Toxicológicas e Bromatológicas, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Oliveira CNS; Programa de Pós-Graduação em Biociências e Biotecnologia Aplicadas à Farmácia, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Degiovani AM; Programa de Pós-Graduação em Imunologia Básica e Aplicada, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Amazonas, Manaus, Amazonas, Brazil.
  • Ostini FM; Departamento de Análises Clínicas, Toxicológicas e Bromatológicas, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Constant LF; Departamento de Química, Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • de Amorim AP; Departamento de Química, Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Vilar FC; Departamento de Análises Clínicas, Toxicológicas e Bromatológicas, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Feitosa MR; Programa de Pós-Graduação em Imunologia Básica e Aplicada, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Parra RS; Hospital Santa Casa de Misericórdia de Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • da Rocha JJR; Hospital Santa Casa de Misericórdia de Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Feres O; Hospital Santa Casa de Misericórdia de Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Gaspar GG; Hospital Santa Casa de Misericórdia de Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Viana AL; Departamento de Clínica Médica, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Fernandes APM; Hospital São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Santos IKFM; Hospital São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Russo EMS; Departamento de Cirurgia e Anatomia, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Cardoso CRB; Hospital São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Sorgi CA; Departamento de Cirurgia e Anatomia, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Faccioli LH; Hospital São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Bonato VLD; Departamento de Cirurgia e Anatomia, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
  • Dias-Baruffi M; Hospital São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
Immunology ; 169(3): 323-343, 2023 07.
Article in English | MEDLINE | ID: covidwho-2230142
ABSTRACT
COVID-19 has a broad spectrum of clinical manifestations associated with the host immune response heterogeneity. Despite the advances in COVID-19 research, it is still crucial to seek a panel of molecular markers that enable accurate stratification of COVID-19 patients. Here, we performed a study that combined analysis of blood transcriptome, demographic data, clinical aspects and laboratory findings from 66 participants classified into different degrees of COVID-19 severity and healthy subjects. We identified a perturbation in blood-leukocyte transcriptional profile associated with COVID-19 aggravation, which was mainly related to processes that disfavoured lymphocyte activation and favoured neutrophil activation. This transcriptional profile stratified patients according to COVID-19 severity. Hence, it enabled identification of a turning point in transcriptional dynamics that distinguished disease outcomes and non-hospitalized from hospitalized moderate patients. Central genes of this unique neutrophil signature were S100A9, ANXA3, CEACAM6, VNN1, OLFM4, IL1R2, TCN1 and CD177. Our study indicates the molecular changes that are linked with the differing clinical aspects presented by humans when suffering from COVID-19, which involve neutrophil activation.
Subject(s)
Keywords

Full text: Available Collection: International databases Database: MEDLINE Main subject: COVID-19 Type of study: Prognostic study Limits: Humans Language: English Journal: Immunology Year: 2023 Document Type: Article Affiliation country: Imm.13631

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