Direct diagnostic testing of SARS-CoV-2 without the need for prior RNA extraction.
Sci Rep
; 11(1): 2402, 2021 01 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: covidwho-1054048
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ABSTRACT
The COVID-19 pandemic has resulted in an urgent need for a rapid, point of care diagnostic testing that could be rapidly scaled on a worldwide level. We developed and tested a highly sensitive and robust assay based on reverse transcription loop mediated isothermal amplification (RT-LAMP) that uses readily available reagents and a simple heat block using contrived spike-in and actual clinical samples. RT-LAMP testing on RNA-spiked samples showed a limit of detection (LoD) of 2.5 copies/µl of viral transport media. RT-LAMP testing directly on clinical nasopharyngeal swab samples in viral transport media had an 85% positive percentage agreement (PPA) (17/20), and 100% negative percentage agreement (NPV) and delivered results in 30 min. Our optimized RT-LAMP based testing method is a scalable system that is sufficiently sensitive and robust to test for SARS-CoV-2 directly on clinical nasopharyngeal swab samples in viral transport media in 30 min at the point of care without the need for specialized or proprietary equipment or reagents. This cost-effective and efficient one-step testing method can be readily available for COVID-19 testing world-wide, especially in resource poor settings.
Texto completo:
Disponible
Colección:
Bases de datos internacionales
Base de datos:
MEDLINE
Asunto principal:
ARN Viral
/
Técnicas de Amplificación de Ácido Nucleico
/
Técnicas de Diagnóstico Molecular
/
Prueba de COVID-19
/
SARS-CoV-2
/
COVID-19
Tipo de estudio:
Estudios diagnósticos
/
Estudio pronóstico
Límite:
Humanos
Idioma:
Inglés
Revista:
Sci Rep
Año:
2021
Tipo del documento:
Artículo
País de afiliación:
S41598-021-81487-y
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