Cet article est une Preprint
Les preprints sont des rapports de recherche préliminaires qui n'ont pas été certifiés par l’évaluation par les pairs. Ils ne devraient pas être considérés comme guidant la pratique clinique ou les comportements liés à la santé et ne devraient pas être rapportés dans les médias comme des informations établies.
Les preprints publiées en ligne permettent aux auteurs de recevoir des commentaires rapidement, et toute la communauté scientifique peut évaluer indépendamment le travail et répondre en conséquence. Ces commentaires sont publiés avec les preprints que quiconque peut lire et servir d’évaluation post-publication.
The emergence and ongoing convergent evolution of the N501Y lineages coincides with a major global shift in the SARS-CoV-2 selective landscape (preprint)
medrxiv; 2021.
Preprint
Dans Anglais
| medRxiv | ID: ppzbmed-10.1101.2021.02.23.21252268
ABSTRACT
The emergence and rapid rise in prevalence of three independent SARS-CoV-2 '501Y lineages', B.1.1.7, B.1.351 and P.1, in the last three months of 2020 has prompted renewed concerns about the evolutionarily capacity of SARS-CoV-2 to adapt to both rising population immunity and public health interventions such as vaccines and social distancing. Viruses giving rise to the different 501Y lineages have, presumably under intense natural selection following a shift in host environment, independently acquired multiple unique and convergent mutations. As a consequence all have gained epidemiological and immunological properties that will likely complicate the control of COVID-19. Here, by examining patterns of mutations that arose in SARS-CoV-2 genomes during the pandemic we find evidence of a major change in the selective forces acting on immunologically important SARS-CoV-2 genes (such as N and S) that likely coincided with the emergence of the 501Y lineages. In addition to involving continuing sequence diversification, we find evidence that a significant portion of the ongoing adaptive evolution of the 501Y lineages also involves further convergence between the lineages. Our findings highlight the importance of monitoring how members of these known 501Y lineages, and others still undiscovered, are convergently evolving similar strategies to ensure their persistence in the face of mounting infection and vaccine induced host immune recognition.
Texte intégral:
Disponible
Collection:
Preprints
Base de données:
medRxiv
Sujet Principal:
COVID-19
langue:
Anglais
Année:
2021
Type de document:
Preprint
Documents relatifs à ce sujet
MEDLINE
...
LILACS
LIS