Detalles de la búsqueda
1.
Cell-type-specific 3D epigenomes in the developing human cortex.
Nature
; 587(7835): 644-649, 2020 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33057195
2.
Publisher Correction: Sensory experience remodels genome architecture in neural circuit to drive motor learning.
Nature
; 570(7760): E33, 2019 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31114059
3.
Sensory experience remodels genome architecture in neural circuit to drive motor learning.
Nature
; 569(7758): 708-713, 2019 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31068695
4.
Circular ecDNA promotes accessible chromatin and high oncogene expression.
Nature
; 575(7784): 699-703, 2019 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31748743
5.
HiC-ACT: improved detection of chromatin interactions from Hi-C data via aggregated Cauchy test.
Am J Hum Genet
; 108(2): 257-268, 2021 02 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33545029
6.
SnapHiC: a computational pipeline to identify chromatin loops from single-cell Hi-C data.
Nat Methods
; 18(9): 1056-1059, 2021 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34446921
7.
A systematic evaluation of Hi-C data enhancement methods for enhancing PLAC-seq and HiChIP data.
Brief Bioinform
; 23(3)2022 05 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35488276
8.
Transcriptional network orchestrating regional patterning of cortical progenitors.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 118(51)2021 12 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34921112
9.
HPRep: Quantifying Reproducibility in HiChIP and PLAC-Seq Datasets.
Curr Issues Mol Biol
; 43(2): 1156-1170, 2021 Sep 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34563051
10.
Global analysis of histone modifications and long-range chromatin interactions revealed the differential cistrome changes and novel transcriptional players in human dilated cardiomyopathy.
J Mol Cell Cardiol
; 145: 30-42, 2020 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32533974
11.
MAPS: Model-based analysis of long-range chromatin interactions from PLAC-seq and HiChIP experiments.
PLoS Comput Biol
; 15(4): e1006982, 2019 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30986246
12.
Alignment-free clustering of large data sets of unannotated protein conserved regions using minhashing.
BMC Bioinformatics
; 19(1): 83, 2018 03 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29506470
13.
HPTAD: A computational method to identify topologically associating domains from HiChIP and PLAC-seq datasets.
Comput Struct Biotechnol J
; 21: 931-939, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38213897
14.
Combinatorial transcription factor binding encodes cis-regulatory wiring of forebrain GABAergic neurogenesis.
bioRxiv
; 2023 Jun 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37425940
15.
SnapHiC2: A computationally efficient loop caller for single cell Hi-C data.
Comput Struct Biotechnol J
; 20: 2778-2783, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35685374
16.
Proximity Ligation-Assisted ChIP-Seq (PLAC-Seq).
Methods Mol Biol
; 2351: 181-199, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34382190
17.
MUNIn: A statistical framework for identifying long-range chromatin interactions from multiple samples.
HGG Adv
; 2(3)2021 Jul 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34485947
18.
FIREcaller: Detecting frequently interacting regions from Hi-C data.
Comput Struct Biotechnol J
; 19: 355-362, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33489005
19.
Parallel characterization of cis-regulatory elements for multiple genes using CRISPRpath.
Sci Adv
; 7(38): eabi4360, 2021 Sep 17.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34524848
20.
An ultra high-throughput method for single-cell joint analysis of open chromatin and transcriptome.
Nat Struct Mol Biol
; 26(11): 1063-1070, 2019 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31695190