Detalles de la búsqueda
1.
Enabling full-length evolutionary profiles based deep convolutional neural network for predicting DNA-binding proteins from sequence.
Proteins
; 88(1): 15-30, 2020 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31228283
2.
Integrating sequence and gene expression information predicts genome-wide DNA-binding proteins and suggests a cooperative mechanism.
Nucleic Acids Res
; 46(1): 54-70, 2018 01 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29186632
3.
Intestinal Epithelium-Derived Luminally Released Extracellular Vesicles in Sepsis Exhibit the Ability to Suppress TNF-a and IL-17A Expression in Mucosal Inflammation.
Int J Mol Sci
; 21(22)2020 Nov 10.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33182773
4.
APBioNet's annual International Conference on Bioinformatics (InCoB) returns to India in 2018.
BMC Genomics
; 19(Suppl 9): 266, 2019 Apr 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30999857
5.
Deciphering RNA-Recognition Patterns of Intrinsically Disordered Proteins.
Int J Mol Sci
; 19(6)2018 May 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29843482
6.
RNA polymerase III regulates cytosolic RNA:DNA hybrids and intracellular microRNA expression.
J Biol Chem
; 290(12): 7463-73, 2015 Mar 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25623070
7.
Improved pose and affinity predictions using different protocols tailored on the basis of data availability.
J Comput Aided Mol Des
; 30(9): 817-828, 2016 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27714493
8.
Novel approach for selecting the best predictor for identifying the binding sites in DNA binding proteins.
Nucleic Acids Res
; 41(16): 7606-14, 2013 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23788679
9.
Distinct transcriptional regulatory modules underlie STAT3's cell type-independent and cell type-specific functions.
Nucleic Acids Res
; 41(4): 2155-70, 2013 Feb 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23295670
10.
Prediction and experimental validation of a putative non-consensus binding site for transcription factor STAT3 in serum amyloid A gene promoter.
Biochim Biophys Acta
; 1830(6): 3650-5, 2013 Jun.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-23391827
11.
Conformational changes in DNA-binding proteins: relationships with precomplex features and contributions to specificity and stability.
Proteins
; 82(5): 841-57, 2014 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24265157
12.
Deconstructing RNA: optical measurement of composition and structure.
Phys Chem Chem Phys
; 15(31): 13199-208, 2013 Aug 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23824161
13.
Analysis and Prediction of Pathogen Nucleic Acid Specificity for Toll-like Receptors in Vertebrates.
J Mol Biol
; 435(17): 168208, 2023 09 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37479078
14.
CCRXP: exploring clusters of conserved residues in protein structures.
Nucleic Acids Res
; 38(Web Server issue): W398-401, 2010 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20457748
15.
Predictive modeling of moonlighting DNA-binding proteins.
NAR Genom Bioinform
; 4(4): lqac091, 2022 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36474806
16.
Understanding disorder-to-order transitions in protein-RNA complexes using molecular dynamics simulations.
J Biomol Struct Dyn
; 40(17): 7915-7925, 2022 10.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33779503
17.
Inadequacy of Evolutionary Profiles Vis-a-vis Single Sequences in Predicting Transient DNA-Binding Sites in Proteins.
J Mol Biol
; 434(13): 167640, 2022 07 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35597551
18.
Host-pathogen protein-nucleic acid interactions: A comprehensive review.
Comput Struct Biotechnol J
; 20: 4415-4436, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36051878
19.
Unraveling molecular mechanisms of head and neck cancer.
Crit Rev Oncol Hematol
; 178: 103778, 2022 Oct.
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| MEDLINE | ID: mdl-35932993
20.
Prediction of dinucleotide-specific RNA-binding sites in proteins.
BMC Bioinformatics
; 12 Suppl 13: S5, 2011.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22373260