Detalles de la búsqueda
1.
PanEffect: a pan-genome visualization tool for variant effects in maize.
Bioinformatics
; 40(2)2024 02 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38337024
2.
Functional annotation and meta-analysis of maize transcriptomes reveal genes involved in biotic and abiotic stress.
BMC Genomics
; 25(1): 533, 2024 May 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38816789
3.
Co-expression pan-network reveals genes involved in complex traits within maize pan-genome.
BMC Plant Biol
; 22(1): 595, 2022 Dec 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36529716
4.
qTeller: a tool for comparative multi-genomic gene expression analysis.
Bioinformatics
; 38(1): 236-242, 2021 12 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34406385
5.
FINDER: an automated software package to annotate eukaryotic genes from RNA-Seq data and associated protein sequences.
BMC Bioinformatics
; 22(1): 205, 2021 Apr 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33879057
6.
A pan-genomic approach to genome databases using maize as a model system.
BMC Plant Biol
; 21(1): 385, 2021 Aug 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34416864
7.
MaizeGDB 2018: the maize multi-genome genetics and genomics database.
Nucleic Acids Res
; 47(D1): D1146-D1154, 2019 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30407532
8.
GenomeQC: a quality assessment tool for genome assemblies and gene structure annotations.
BMC Genomics
; 21(1): 193, 2020 Mar 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32122303
9.
Tissue-specific gene expression and protein abundance patterns are associated with fractionation bias in maize.
BMC Plant Biol
; 20(1): 4, 2020 Jan 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31900107
10.
PedigreeNet: a web-based pedigree viewer for biological databases.
Bioinformatics
; 35(20): 4184-4186, 2019 10 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30903182
11.
Haplotype structure in commercial maize breeding programs in relation to key founder lines.
Theor Appl Genet
; 133(2): 547-561, 2020 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31749017
12.
Crowdsourcing image analysis for plant phenomics to generate ground truth data for machine learning.
PLoS Comput Biol
; 14(7): e1006337, 2018 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30059508
13.
MaizeGDB update: new tools, data and interface for the maize model organism database.
Nucleic Acids Res
; 44(D1): D1195-201, 2016 Jan 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26432828
14.
Automated update, revision, and quality control of the maize genome annotations using MAKER-P improves the B73 RefGen_v3 gene models and identifies new genes.
Plant Physiol
; 167(1): 25-39, 2015 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25384563
15.
Harnessing the predicted maize pan-interactome for putative gene function prediction and prioritization of candidate genes for important traits.
G3 (Bethesda)
; 14(5)2024 05 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38492232
16.
Enhanced pan-genomic resources at the maize genetics and genomics database.
Genetics
; 227(1)2024 May 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38577974
17.
PhosBoost: Improved phosphorylation prediction recall using gradient boosting and protein language models.
Plant Direct
; 7(12): e554, 2023 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38124705
18.
Maize Feature Store: A centralized resource to manage and analyze curated maize multi-omics features for machine learning applications.
Database (Oxford)
; 20232023 11 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37935586
19.
Maize protein structure resources at the maize genetics and genomics database.
Genetics
; 224(1)2023 05 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36755109
20.
Predicting Tissue-Specific mRNA and Protein Abundance in Maize: A Machine Learning Approach.
Front Artif Intell
; 5: 830170, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35719692