Detalles de la búsqueda
1.
Hunting down zinc(II)-binding sites in proteins with distance matrices.
Bioinformatics
; 39(11)2023 11 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37878807
2.
Upgrading of the general AMBER force field 2 for fluorinated alcohol biosolvents: A validation for water solutions and melittin solvation.
J Pept Sci
; 30(2): e3543, 2024 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37734745
3.
A New Paradigm of Multiheme Cytochrome Evolution by Grafting and Pruning Protein Modules.
Mol Biol Evol
; 39(7)2022 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35714268
4.
Ruthenium(II) Polypyridyl Complexes and Metronidazole Derivatives: A Powerful Combination in the Design of Photoresponsive Antibacterial Agents Effective under Hypoxic Conditions.
Inorg Chem
; 62(20): 7716-7727, 2023 May 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37163381
5.
Learning to Identify Physiological and Adventitious Metal-Binding Sites in the Three-Dimensional Structures of Proteins by Following the Hints of a Deep Neural Network.
J Chem Inf Model
; 62(12): 2951-2960, 2022 06 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35679182
6.
Structural Bioinformatics and Deep Learning of Metalloproteins: Recent Advances and Applications.
Int J Mol Sci
; 23(14)2022 Jul 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35887033
7.
MetalPDB in 2018: a database of metal sites in biological macromolecular structures.
Nucleic Acids Res
; 46(D1): D459-D464, 2018 01 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29077942
8.
HIV-1 Tat Protein Enters Dysfunctional Endothelial Cells via Integrins and Renders Them Permissive to Virus Replication.
Int J Mol Sci
; 22(1)2020 Dec 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33396807
9.
Upgrading and Validation of the AMBER Force Field for Histidine and Cysteine Zinc(II)-Binding Residues in Sites with Four Protein Ligands.
J Chem Inf Model
; 59(9): 3803-3816, 2019 09 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31385702
10.
MetalPredator: a web server to predict iron-sulfur cluster binding proteomes.
Bioinformatics
; 32(18): 2850-2, 2016 09 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27273670
11.
Identification of the zinc, copper and cadmium metalloproteome of the protozoon Tetrahymena thermophila by systematic bioinformatics.
Arch Microbiol
; 199(8): 1141-1149, 2017 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28478602
12.
Exploiting Bacterial Operons To Illuminate Human Iron-Sulfur Proteins.
J Proteome Res
; 15(4): 1308-22, 2016 Apr 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26889782
13.
Minimal Functional Sites in Metalloproteins and Their Usage in Structural Bioinformatics.
Int J Mol Sci
; 17(5)2016 May 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27153067
14.
MetalPDB: a database of metal sites in biological macromolecular structures.
Nucleic Acids Res
; 41(Database issue): D312-9, 2013 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23155064
15.
MetalS(3), a database-mining tool for the identification of structurally similar metal sites.
J Biol Inorg Chem
; 19(6): 937-45, 2014 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24699831
16.
MACiE: exploring the diversity of biochemical reactions.
Nucleic Acids Res
; 40(Database issue): D783-9, 2012 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22058127
17.
A database overview of metal-coordination distances in metalloproteins.
Acta Crystallogr D Struct Biol
; 80(Pt 5): 362-376, 2024 May 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38682667
18.
FindGeo: a tool for determining metal coordination geometry.
Bioinformatics
; 28(12): 1658-60, 2012 Jun 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22556364
19.
MetalS2: a tool for the structural alignment of minimal functional sites in metal-binding proteins and nucleic acids.
J Chem Inf Model
; 53(11): 3064-75, 2013 Nov 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24117467
20.
Metal-induced structural variability of mononuclear metal-binding sites from a database perspective.
J Inorg Biochem
; 238: 112025, 2023 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36270040