Detalles de la búsqueda
1.
Scalable Integration of Multiomic Single Cell Data Using Generative Adversarial Networks.
Bioinformatics
; 2024 May 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38696763
2.
A Bayesian method to infer copy number clones from single-cell RNA and ATAC sequencing.
PLoS Comput Biol
; 19(11): e1011557, 2023 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37917660
3.
LACE 2.0: an interactive R tool for the inference and visualization of longitudinal cancer evolution.
BMC Bioinformatics
; 24(1): 99, 2023 Mar 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36932333
4.
A review of computational strategies for denoising and imputation of single-cell transcriptomic data.
Brief Bioinform
; 22(4)2021 07 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33003202
5.
J-SPACE: a Julia package for the simulation of spatial models of cancer evolution and of sequencing experiments.
BMC Bioinformatics
; 23(1): 269, 2022 Jul 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35804300
6.
Chemotherapy after PD-1 inhibitors in relapsed/refractory Hodgkin lymphoma: Outcomes and clonal evolution dynamics.
Br J Haematol
; 198(1): 82-92, 2022 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35468225
7.
On the Use of Topological Features of Metabolic Networks for the Classification of Cancer Samples.
Curr Genomics
; 22(2): 88-97, 2021 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34220296
8.
Learning mutational graphs of individual tumour evolution from single-cell and multi-region sequencing data.
BMC Bioinformatics
; 20(1): 210, 2019 Apr 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31023236
9.
Algorithmic methods to infer the evolutionary trajectories in cancer progression.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 113(28): E4025-34, 2016 07 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27357673
10.
Integration of transcriptomic data and metabolic networks in cancer samples reveals highly significant prognostic power.
J Biomed Inform
; 87: 37-49, 2018 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30244122
11.
TRONCO: an R package for the inference of cancer progression models from heterogeneous genomic data.
Bioinformatics
; 32(12): 1911-3, 2016 06 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26861821
12.
CABeRNET: a Cytoscape app for augmented Boolean models of gene regulatory NETworks.
BMC Bioinformatics
; 17: 64, 2016 Feb 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26846964
13.
CAPRI: efficient inference of cancer progression models from cross-sectional data.
Bioinformatics
; 31(18): 3016-26, 2015 Sep 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25971740
14.
Different regulation of miR-29a-3p in glomeruli and tubules in an experimental model of angiotensin II-dependent hypertension: potential role in renal fibrosis.
Clin Exp Pharmacol Physiol
; 43(3): 335-42, 2016 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26700017
15.
Automatising the analysis of stochastic biochemical time-series.
BMC Bioinformatics
; 16 Suppl 9: S8, 2015.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26051821
16.
GESTODIFFERENT: a Cytoscape plugin for the generation and the identification of gene regulatory networks describing a stochastic cell differentiation process.
Bioinformatics
; 29(4): 513-4, 2013 Feb 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23292740
17.
A review of spatial computational models for multi-cellular systems, with regard to intestinal crypts and colorectal cancer development.
J Math Biol
; 66(7): 1409-62, 2013 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22565629
18.
Reverse engineering dynamic temporal models of biological processes and their relationships.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 107(28): 12511-6, 2010 Jul 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20571120
19.
Evolutionary signatures of human cancers revealed via genomic analysis of over 35,000 patients.
Nat Commun
; 14(1): 5982, 2023 09 25.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37749078
20.
Early detection and improved genomic surveillance of SARS-CoV-2 variants from deep sequencing data.
iScience
; 25(6): 104487, 2022 Jun 17.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35677393