Detalles de la búsqueda
1.
ATOMDANCE: Kernel-based denoising and choreographic analysis for protein dynamic comparison.
Biophys J
; 2024 Mar 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38515299
2.
DROIDS 3.0-Detecting Genetic and Drug Class Variant Impact on Conserved Protein Binding Dynamics.
Biophys J
; 118(3): 541-551, 2020 02 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31928763
3.
DROIDS 1.20: A GUI-Based Pipeline for GPU-Accelerated Comparative Protein Dynamics.
Biophys J
; 114(5): 1009-1017, 2018 03 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29539389
4.
Triplet-Based Codon Organization Optimizes the Impact of Synonymous Mutation on Nucleic Acid Molecular Dynamics.
J Mol Evol
; 86(2): 91-102, 2018 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29344693
5.
Synonymous codon bias and functional constraint on GC3-related DNA backbone dynamics in the prokaryotic nucleoid.
Nucleic Acids Res
; 42(17): 10915-26, 2014.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25200075
6.
Evolution of drug resistance drives destabilization of flap region dynamics in HIV-1 protease.
Biophys Rep (N Y)
; 3(3): 100121, 2023 Sep 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37662576
7.
Persistent cross-species SARS-CoV-2 variant infectivity predicted via comparative molecular dynamics simulation.
R Soc Open Sci
; 9(11): 220600, 2022 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36340517
8.
Identifying vaccine escape sites via statistical comparisons of short-term molecular dynamics.
Biophys Rep (N Y)
; 2(2): 100056, 2022 Jun 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35403093
9.
Functional binding dynamics relevant to the evolution of zoonotic spillovers in endemic and emergent Betacoronavirus strains.
J Biomol Struct Dyn
; 40(21): 10978-10996, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34286673
10.
Function and evolution of B-Raf loop dynamics relevant to cancer recurrence under drug inhibition.
J Biomol Struct Dyn
; 40(1): 468-483, 2022 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32897175
11.
Statistical machine learning for comparative protein dynamics with the DROIDS/maxDemon software pipeline.
STAR Protoc
; 3(1): 101194, 2022 03 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35252883
12.
Behavioral impacts on residential food provisioning, use, and waste during the COVID-19 pandemic.
Sustain Prod Consum
; 28: 315-325, 2021 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34722846
13.
Functional binding dynamics relevant to the evolution of zoonotic spillovers in endemic and emergent Betacoronavirus strains.
bioRxiv
; 2021 Apr 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33501438
14.
The enrichment of TATA box and the scarcity of depleted proximal nucleosome in the promoters of duplicated yeast genes.
J Mol Evol
; 70(1): 69-73, 2010 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20013336
15.
Comparative Molecular Dynamics Simulations Provide Insight Into Antibiotic Interactions: A Case Study Using the Enzyme L,L-Diaminopimelate Aminotransferase (DapL).
Front Mol Biosci
; 7: 46, 2020.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32274387
16.
How accurate is the phenotype? - an analysis of developmental noise in a cotton aphid clone.
BMC Dev Biol
; 8: 19, 2008 Feb 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18294398
17.
Phenology of body mass changes during reproduction in a nomadic, tropical waterbird, the Scarlet Ibis (Eudocimus ruber).
Zoo Biol
; 27(5): 360-70, 2008 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19360630
18.
Can all heritable biology really be reduced to a single dimension?
Gene
; 578(2): 162-8, 2016 Mar 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26723512
19.
TRX-LOGOS - a graphical tool to demonstrate DNA information content dependent upon backbone dynamics in addition to base sequence.
Source Code Biol Med
; 10: 10, 2015.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26413153
20.
Functional conservation of nucleosome formation selectively biases presumably neutral molecular variation in yeast genomes.
Genome Biol Evol
; 3: 15-22, 2011.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21135411