Detalles de la búsqueda
1.
Using single-cell models to predict the functionality of synthetic circuits at the population scale.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(11): e2114438119, 2022 03 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35271387
2.
Bayesian filtering for model predictive control of stochastic gene expression in single cells.
Phys Biol
; 20(5)2023 07 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37343568
3.
Parameter inference for stochastic biochemical models from perturbation experiments parallelised at the single cell level.
PLoS Comput Biol
; 18(3): e1009950, 2022 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35303737
4.
Beyond the chemical master equation: Stochastic chemical kinetics coupled with auxiliary processes.
PLoS Comput Biol
; 17(7): e1009214, 2021 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34319979
5.
Abstracting the dynamics of biological pathways using information theory: a case study of apoptosis pathway.
Bioinformatics
; 33(13): 1980-1986, 2017 Jul 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28200026
6.
What Population Reveals about Individual Cell Identity: Single-Cell Parameter Estimation of Models of Gene Expression in Yeast.
PLoS Comput Biol
; 12(2): e1004706, 2016 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26859137
7.
A platform for rapid prototyping of synthetic gene networks in mammalian cells.
Nucleic Acids Res
; 42(21): 13440-51, 2014 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25378321
8.
Modeling dynamics of cell-to-cell variability in TRAIL-induced apoptosis explains fractional killing and predicts reversible resistance.
PLoS Comput Biol
; 10(10): e1003893, 2014 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25340343
9.
Long-term model predictive control of gene expression at the population and single-cell levels.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 109(35): 14271-6, 2012 Aug 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22893687
10.
Composition and abstraction of logical regulatory modules: application to multicellular systems.
Bioinformatics
; 29(6): 749-57, 2013 Mar 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23341501
11.
STL-based analysis of TRAIL-induced apoptosis challenges the notion of type I/type II cell line classification.
PLoS Comput Biol
; 9(5): e1003056, 2013.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23675292
12.
Design and Model-Driven Analysis of Synthetic Circuits with the Staphylococcus aureus Dead-Cas9 (sadCas9) as a Programmable Transcriptional Regulator in Bacteria.
ACS Synth Biol
; 13(3): 763-780, 2024 03 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38374729
13.
Maximizing protein production by keeping cells at optimal secretory stress levels using real-time control approaches.
Nat Commun
; 14(1): 3028, 2023 05 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37231013
14.
Enhancing bioreactor arrays for automated measurements and reactive control with ReacSight.
Nat Commun
; 13(1): 3363, 2022 06 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35690608
15.
Enabling reactive microscopy with MicroMator.
Nat Commun
; 13(1): 2199, 2022 04 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35459274
16.
Efficient parameter search for qualitative models of regulatory networks using symbolic model checking.
Bioinformatics
; 26(18): i603-10, 2010 Sep 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20823328
17.
To quarantine, or not to quarantine: A theoretical framework for disease control via contact tracing.
Epidemics
; 34: 100428, 2021 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33444928
18.
A light tunable differentiation system for the creation and control of consortia in yeast.
Nat Commun
; 12(1): 5829, 2021 10 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34611168
19.
A general computational method for robustness analysis with applications to synthetic gene networks.
Bioinformatics
; 25(12): i169-78, 2009 Jun 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19477984
20.
Robustness analysis and tuning of synthetic gene networks.
Bioinformatics
; 23(18): 2415-22, 2007 Sep 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17660209