Detalles de la búsqueda
1.
Structure and elevator mechanism of the mammalian sodium/proton exchanger NHE9.
EMBO J
; 39(24): e105908, 2020 12 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33118634
2.
Alternative proton-binding site and long-distance coupling in Escherichia coli sodium-proton antiporter NhaA.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 117(41): 25517-25522, 2020 10 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32973095
3.
Precise force-field-based calculations of octanol-water partition coefficients for the SAMPL7 molecules.
J Comput Aided Mol Des
; 35(7): 853-870, 2021 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34232435
4.
Correction: Path Similarity Analysis: A Method for Quantifying Macromolecular Pathways.
PLoS Comput Biol
; 15(6): e1007136, 2019 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31206513
5.
Prediction of octanol-water partition coefficients for the SAMPL6-[Formula: see text] molecules using molecular dynamics simulations with OPLS-AA, AMBER and CHARMM force fields.
J Comput Aided Mol Des
; 34(5): 543-560, 2020 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31960254
6.
A two-domain elevator mechanism for sodium/proton antiport.
Nature
; 501(7468): 573-7, 2013 Sep 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23995679
7.
Molecular mechanism of ligand recognition by membrane transport protein, Mhp1.
EMBO J
; 33(16): 1831-44, 2014 Aug 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24952894
8.
Ligandbook: an online repository for small and drug-like molecule force field parameters.
Bioinformatics
; 33(11): 1747-1749, 2017 Jun 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28130228
9.
SAMPL6: calculation of macroscopic pKa values from ab initio quantum mechanical free energies.
J Comput Aided Mol Des
; 32(10): 1203-1216, 2018 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30084080
10.
Topological Dissection of the Membrane Transport Protein Mhp1 Derived from Cysteine Accessibility and Mass Spectrometry.
Anal Chem
; 89(17): 8844-8852, 2017 09 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28726379
11.
Path Similarity Analysis: A Method for Quantifying Macromolecular Pathways.
PLoS Comput Biol
; 11(10): e1004568, 2015 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26488417
12.
Prediction of cyclohexane-water distribution coefficients for the SAMPL5 data set using molecular dynamics simulations with the OPLS-AA force field.
J Comput Aided Mol Des
; 30(11): 1045-1058, 2016 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27581968
13.
Understanding thermosensitive transient receptor potential channels as versatile polymodal cellular sensors.
Biochemistry
; 54(15): 2401-13, 2015 Apr 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25812016
14.
Peptide Folding in Translocon-Like Pores.
J Membr Biol
; 248(3): 407-17, 2015 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26016471
15.
Prediction of hydration free energies for the SAMPL4 diverse set of compounds using molecular dynamics simulations with the OPLS-AA force field.
J Comput Aided Mol Des
; 28(3): 265-76, 2014 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24557853
16.
Kinetic Diagram Analysis: A Python Library for Calculating Steady-State Observables of Kinetic Systems Analytically.
bioRxiv
; 2024 May 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38854140
17.
Chloride binding and cholesterol effects on high frequency complex nonlinear capacitance (cNLC) in the mouse outer hair cell: experiment and molecular dynamics.
bioRxiv
; 2024 Jan 31.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38352579
18.
A novel congenital myasthenic syndrome due to decreased acetylcholine receptor ion-channel conductance.
Brain
; 135(Pt 4): 1070-80, 2012 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22382357
19.
Thermodynamically consistent determination of free energies and rates in kinetic cycle models.
Biophys Rep (N Y)
; 3(3): 100120, 2023 Sep 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37638349
20.
Thermodynamically consistent determination of free energies and rates in kinetic cycle models.
bioRxiv
; 2023 Aug 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37066357