Detalles de la búsqueda
1.
CARD 2023: expanded curation, support for machine learning, and resistome prediction at the Comprehensive Antibiotic Resistance Database.
Nucleic Acids Res
; 51(D1): D690-D699, 2023 01 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36263822
2.
Mock microbial community meta-analysis using different trimming of amplicon read lengths.
Environ Microbiol
; 26(1): e16566, 2024 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38149467
3.
The Community Coevolution Model with Application to the Study of Evolutionary Relationships between Genes Based on Phylogenetic Profiles.
Syst Biol
; 72(3): 559-574, 2023 Jun 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35904761
4.
Machine Learning for Antimicrobial Resistance Prediction: Current Practice, Limitations, and Clinical Perspective.
Clin Microbiol Rev
; 35(3): e0017921, 2022 09 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35612324
5.
deepSimDEF: deep neural embeddings of gene products and gene ontology terms for functional analysis of genes.
Bioinformatics
; 38(11): 3051-3061, 2022 05 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35536192
6.
Vaginal microbiota in women with spontaneous preterm labor versus those with term labor in Kenya: a case control study.
BMC Microbiol
; 22(1): 270, 2022 11 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36357861
7.
CARD 2020: antibiotic resistome surveillance with the comprehensive antibiotic resistance database.
Nucleic Acids Res
; 48(D1): D517-D525, 2020 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31665441
8.
PSORTm: a bacterial and archaeal protein subcellular localization prediction tool for metagenomics data.
Bioinformatics
; 36(10): 3043-3048, 2020 05 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32108861
9.
Cellulase-Hemicellulase Activities and Bacterial Community Composition of Different Soils from Algerian Ecosystems.
Microb Ecol
; 77(3): 713-725, 2019 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30209585
10.
Environmental extremes drive population structure at the northern range limit of Atlantic salmon in North America.
Mol Ecol
; 27(20): 4026-4040, 2018 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30152128
11.
Algal genomes reveal evolutionary mosaicism and the fate of nucleomorphs.
Nature
; 492(7427): 59-65, 2012 Dec 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23201678
12.
simDEF: definition-based semantic similarity measure of gene ontology terms for functional similarity analysis of genes.
Bioinformatics
; 32(9): 1380-7, 2016 05 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26708333
13.
Transfer of energy pathway genes in microbial enhanced biological phosphorus removal communities.
BMC Genomics
; 16: 526, 2015 Jul 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26173980
14.
STAMP: statistical analysis of taxonomic and functional profiles.
Bioinformatics
; 30(21): 3123-4, 2014 Nov 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25061070
15.
Supertrees Based on the Subtree Prune-and-Regraft Distance.
Syst Biol
; 63(4): 566-81, 2014 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24695589
16.
SPANNER: taxonomic assignment of sequences using pyramid matching of similarity profiles.
Bioinformatics
; 29(15): 1858-64, 2013 Aug 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23732273
17.
Rapid identification of high-confidence taxonomic assignments for metagenomic data.
Nucleic Acids Res
; 40(14): e111, 2012 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22532608
18.
Measuring community similarity with phylogenetic networks.
Mol Biol Evol
; 29(12): 3947-58, 2012 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22915830
19.
Compact and automated eDNA sampler for in situ monitoring of marine environments.
Sci Rep
; 13(1): 5210, 2023 03 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36997631
20.
Profiling novel lateral gene transfer events in the human microbiome.
bioRxiv
; 2023 Aug 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37609252