Detalles de la búsqueda
1.
Hydrodynamic flow and concentration gradients in the gut enhance neutral bacterial diversity.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(1)2022 01 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34969835
2.
Combining phylogeny and coevolution improves the inference of interaction partners among paralogous proteins.
PLoS Comput Biol
; 19(3): e1011010, 2023 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36996234
3.
Correlations from structure and phylogeny combine constructively in the inference of protein partners from sequences.
PLoS Comput Biol
; 18(5): e1010147, 2022 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35576238
4.
Toward a Universal Model for Spatially Structured Populations.
Phys Rev Lett
; 127(21): 218102, 2021 Nov 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34860074
5.
Resist or perish: Fate of a microbial population subjected to a periodic presence of antimicrobial.
PLoS Comput Biol
; 16(4): e1007798, 2020 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32275712
6.
Phylogenetic correlations can suffice to infer protein partners from sequences.
PLoS Comput Biol
; 15(10): e1007179, 2019 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31609984
7.
Revealing evolutionary constraints on proteins through sequence analysis.
PLoS Comput Biol
; 15(4): e1007010, 2019 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31017888
8.
Spatiotemporal pattern formation in E. coli biofilms explained by a simple physical energy balance.
Soft Matter
; 16(2): 494-504, 2020 Jan 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31804652
9.
Inferring interaction partners from protein sequences using mutual information.
PLoS Comput Biol
; 14(11): e1006401, 2018 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30422978
10.
Inferring interaction partners from protein sequences.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 113(43): 12180-12185, 2016 10 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27663738
11.
Quantifying the impact of a periodic presence of antimicrobial on resistance evolution in a homogeneous microbial population of fixed size.
J Theor Biol
; 457: 190-198, 2018 11 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30172688
12.
Fundamental constraints on the abundances of chemotaxis proteins.
Biophys J
; 108(5): 1293-305, 2015 Mar 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25762341
13.
Quantifying the role of population subdivision in evolution on rugged fitness landscapes.
PLoS Comput Biol
; 10(8): e1003778, 2014 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25122220
14.
Interplay of packing and flip-flop in local bilayer deformation. How phosphatidylglycerol could rescue mitochondrial function in a cardiolipin-deficient yeast mutant.
Biophys J
; 107(4): 879-90, 2014 Aug 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25140423
15.
Membrane properties revealed by spatiotemporal response to a local inhomogeneity.
Biochim Biophys Acta
; 1828(4): 1241-9, 2013 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23201541
16.
Evolution of cooperation in deme-structured populations on graphs.
Phys Rev E
; 109(2-1): 024307, 2024 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38491653
17.
Interactions between pili affect the outcome of bacterial competition driven by the type VI secretion system.
Curr Biol
; 34(11): 2403-2417.e9, 2024 Jun 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38749426
18.
Impact of population size on early adaptation in rugged fitness landscapes.
Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci
; 378(1877): 20220045, 2023 05 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37004726
19.
Frequent asymmetric migrations suppress natural selection in spatially structured populations.
PNAS Nexus
; 2(11): pgad392, 2023 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38024415
20.
Generative power of a protein language model trained on multiple sequence alignments.
Elife
; 122023 02 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36734516