Detalles de la búsqueda
1.
The underappreciated diversity of bile acid modifications.
Cell
; 187(7): 1801-1818.e20, 2024 Mar 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38471500
2.
A learned embedding for efficient joint analysis of millions of mass spectra.
Nat Methods
; 19(6): 675-678, 2022 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35637305
3.
Machine learning-based peptide-spectrum match rescoring opens up the immunopeptidome.
Proteomics
; 24(8): e2300336, 2024 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38009585
4.
Universal Spectrum Identifier for mass spectra.
Nat Methods
; 18(7): 768-770, 2021 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34183830
5.
Accelerating open modification spectral library searching on tensor core in high-dimensional space.
Bioinformatics
; 39(7)2023 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37369033
6.
Four layer multi-omics reveals molecular responses to aneuploidy in Leishmania.
PLoS Pathog
; 18(9): e1010848, 2022 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36149920
7.
Benchmarking of Small Molecule Feature Representations for hERG, Nav1.5, and Cav1.2 Cardiotoxicity Prediction.
J Chem Inf Model
; 64(7): 2515-2527, 2024 Apr 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37870574
8.
Open Modification Searching of SARS-CoV-2-Human Protein Interaction Data Reveals Novel Viral Modification Sites.
Mol Cell Proteomics
; 21(12): 100425, 2022 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36241021
9.
Semisupervised Machine Learning for Sensitive Open Modification Spectral Library Searching.
J Proteome Res
; 22(2): 585-593, 2023 02 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36688569
10.
HyperSpec: Ultrafast Mass Spectra Clustering in Hyperdimensional Space.
J Proteome Res
; 22(6): 1639-1648, 2023 06 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37166120
11.
Unified and Standardized Mass Spectrometry Data Processing in Python Using spectrum_utils.
J Proteome Res
; 22(2): 625-631, 2023 02 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36688502
12.
Proteomics Standards Initiative at Twenty Years: Current Activities and Future Work.
J Proteome Res
; 22(2): 287-301, 2023 02 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36626722
13.
Current challenges for unseen-epitope TCR interaction prediction and a new perspective derived from image classification.
Brief Bioinform
; 22(4)2021 07 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33346826
14.
A Comprehensive Evaluation of Consensus Spectrum Generation Methods in Proteomics.
J Proteome Res
; 21(6): 1566-1574, 2022 06 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35549218
15.
Proteomics Standards Initiative's ProForma 2.0: Unifying the Encoding of Proteoforms and Peptidoforms.
J Proteome Res
; 21(4): 1189-1195, 2022 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35290070
16.
The critical role that spectral libraries play in capturing the metabolomics community knowledge.
Metabolomics
; 18(12): 94, 2022 11 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36409434
17.
ppx: Programmatic Access to Proteomics Data Repositories.
J Proteome Res
; 20(9): 4621-4624, 2021 09 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34342226
18.
Open Science Resources for the Mass Spectrometry-Based Analysis of SARS-CoV-2.
J Proteome Res
; 20(3): 1464-1475, 2021 03 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33605735
19.
Large-scale tandem mass spectrum clustering using fast nearest neighbor searching.
Rapid Commun Mass Spectrom
; : e9153, 2021 Jun 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34169593
20.
Current and future deep learning algorithms for tandem mass spectrometry (MS/MS)-based small molecule structure elucidation.
Rapid Commun Mass Spectrom
; : e9120, 2021 May 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33955607