Detalles de la búsqueda
1.
Drug Design in the Exascale Era: A Perspective from Massively Parallel QM/MM Simulations.
J Chem Inf Model
; 63(12): 3647-3658, 2023 06 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37319347
2.
TCDD-Induced Allosteric Perturbation of the AhR:ARNT Binding to DNA.
Int J Mol Sci
; 24(11)2023 May 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37298290
3.
NURA: A curated dataset of nuclear receptor modulators.
Toxicol Appl Pharmacol
; 407: 115244, 2020 11 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32961130
4.
An aryl hydrocarbon receptor from the caecilian Gymnopis multiplicata suggests low dioxin affinity in the ancestor of all three amphibian orders.
Gen Comp Endocrinol
; 299: 113592, 2020 12 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32858041
5.
Transitional States in Ligand-Dependent Transformation of the Aryl Hydrocarbon Receptor into Its DNA-Binding Form.
Int J Mol Sci
; 21(7)2020 Apr 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32252465
6.
The Cellular and Molecular Determinants of Naphthoquinone-Dependent Activation of the Aryl Hydrocarbon Receptor.
Int J Mol Sci
; 21(11)2020 Jun 09.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32526934
7.
Ligand-induced perturbation of the HIF-2α:ARNT dimer dynamics.
PLoS Comput Biol
; 14(2): e1006021, 2018 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29489822
8.
Comparative In Vitro and In Silico Analysis of the Selectivity of Indirubin as a Human Ah Receptor Agonist.
Int J Mol Sci
; 19(9)2018 Sep 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30201897
9.
Deciphering Dimerization Modes of PAS Domains: Computational and Experimental Analyses of the AhR:ARNT Complex Reveal New Insights Into the Mechanisms of AhR Transformation.
PLoS Comput Biol
; 12(6): e1004981, 2016 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-27295348
10.
Modeling Binding with Large Conformational Changes: Key Points in Ensemble-Docking Approaches.
J Chem Inf Model
; 57(7): 1563-1578, 2017 07 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28616990
11.
An Aryl Hydrocarbon Receptor from the Salamander Ambystoma mexicanum Exhibits Low Sensitivity to 2,3,7,8-Tetrachlorodibenzo-p-dioxin.
Environ Sci Technol
; 49(11): 6993-7001, 2015 Jun 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25941739
12.
The AhR Signaling Mechanism: A Structural Point of View.
J Mol Biol
; 436(3): 168296, 2024 02 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37797832
13.
Mechanism of RGD-conjugated nanodevice binding to its target protein integrin αVß3 by atomistic molecular dynamics and machine learning.
Nanoscale
; 16(8): 4063-4081, 2024 Feb 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38334981
14.
Specific ligand binding domain residues confer low dioxin responsiveness to AHR1ß of Xenopus laevis.
Biochemistry
; 52(10): 1746-54, 2013 Mar 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23394719
15.
Comparative analysis of homology models of the AH receptor ligand binding domain: verification of structure-function predictions by site-directed mutagenesis of a nonfunctional receptor.
Biochemistry
; 52(4): 714-25, 2013 Jan 29.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-23286227
16.
Metadynamics simulations for the investigation of drug loading on functionalized inorganic nanoparticles.
Nanoscale
; 15(17): 7909-7919, 2023 May 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37066796
17.
Molecular Dynamics for the Optimal Design of Functionalized Nanodevices to Target Folate Receptors on Tumor Cells.
ACS Biomater Sci Eng
; 9(11): 6123-6137, 2023 11 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37831005
18.
PathDetect-SOM: A Neural Network Approach for the Identification of Pathways in Ligand Binding Simulations.
J Chem Theory Comput
; 18(3): 1957-1968, 2022 Mar 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35213804
19.
Aryl Hydrocarbon Receptor-Dependent and -Independent Pathways Mediate Curcumin Anti-Aging Effects.
Antioxidants (Basel)
; 11(4)2022 Mar 23.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35453298
20.
Conformational and functional analysis of molecular dynamics trajectories by self-organising maps.
BMC Bioinformatics
; 12: 158, 2011 May 14.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21569575