Detalles de la búsqueda
1.
On the utility of ultrafast MS1-only proteomics in drug target discovery studies based on thermal proteome profiling method.
Anal Bioanal Chem
; 2024 May 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38744720
2.
Proteomics-based scoring of cellular response to stimuli for improved characterization of signaling pathway activity.
Proteomics
; 23(5): e2200275, 2023 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36478387
3.
IQMMA: Efficient MS1 Intensity Extraction Pipeline Using Multiple Feature Detection Algorithms for DDA Proteomics.
J Proteome Res
; 22(9): 2827-2835, 2023 09 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37579078
4.
Massive Proteogenomic Reanalysis of Publicly Available Proteomic Datasets of Human Tissues in Search for Protein Recoding via Adenosine-to-Inosine RNA Editing.
J Proteome Res
; 22(6): 1695-1711, 2023 06 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37158322
5.
A Comprehensive Evaluation of Consensus Spectrum Generation Methods in Proteomics.
J Proteome Res
; 21(6): 1566-1574, 2022 06 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35549218
6.
DirectMS1Quant: Ultrafast Quantitative Proteomics with MS/MS-Free Mass Spectrometry.
Anal Chem
; 94(38): 13068-13075, 2022 09 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36094425
7.
On the Feasibility of Using an Ultra-Fast DirectMS1 Method of Proteome-Wide Analysis for Searching Drug Targets in Chemical Proteomics.
Biochemistry (Mosc)
; 87(11): 1342-1353, 2022 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36509723
8.
Boosting MS1-only Proteomics with Machine Learning Allows 2000 Protein Identifications in Single-Shot Human Proteome Analysis Using 5 min HPLC Gradient.
J Proteome Res
; 20(4): 1864-1873, 2021 04 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33720732
9.
Biosaur: An open-source Python software for liquid chromatography-mass spectrometry peptide feature detection with ion mobility support.
Rapid Commun Mass Spectrom
; : e9045, 2021 Jan 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33450063
10.
HUMOS: How to Understand My Orbitrap Spectrum?-An Interactive Web-Based Tool to Teach the Basics of Mass-Spectrometry-Based Proteomics.
J Proteome Res
; 19(10): 3910-3918, 2020 10 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32813527
11.
DirectMS1: MS/MS-Free Identification of 1000 Proteins of Cellular Proteomes in 5 Minutes.
Anal Chem
; 92(6): 4326-4333, 2020 03 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32077687
12.
Rpn4 and proteasome-mediated yeast resistance to ethanol includes regulation of autophagy.
Appl Microbiol Biotechnol
; 104(9): 4027-4041, 2020 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32157425
13.
Scavager: A Versatile Postsearch Validation Algorithm for Shotgun Proteomics Based on Gradient Boosting.
Proteomics
; 19(3): e1800280, 2019 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30537264
14.
Validation of Peptide Identification Results in Proteomics Using Amino Acid Counting.
Proteomics
; 18(23): e1800117, 2018 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30307114
15.
IdentiPy: An Extensible Search Engine for Protein Identification in Shotgun Proteomics.
J Proteome Res
; 17(7): 2249-2255, 2018 07 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29682971
16.
MS/MS-Free Protein Identification in Complex Mixtures Using Multiple Enzymes with Complementary Specificity.
J Proteome Res
; 16(11): 3989-3999, 2017 11 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28905631
17.
Comparative evaluation of label-free quantification methods for shotgun proteomics.
Rapid Commun Mass Spectrom
; 31(7): 606-612, 2017 Apr 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28097710
18.
Yeast Ribonucleotide Reductase Is a Direct Target of the Proteasome and Provides Hyper Resistance to the Carcinogen 4-NQO.
J Fungi (Basel)
; 9(3)2023 Mar 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36983519
19.
AA_stat: Intelligent profiling of in vivo and in vitro modifications from open search results.
J Proteomics
; 248: 104350, 2021 09 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34389500
20.
Improving the Protein Inference from Bottom-Up Proteomic Data Using Identifications from MS1 Spectra.
J Am Soc Mass Spectrom
; 32(5): 1258-1262, 2021 May 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33900766