Detalles de la búsqueda
1.
Pasa: leveraging population pangenome graph to scaffold prokaryote genome assemblies.
Nucleic Acids Res
; 52(3): e15, 2024 Feb 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38084888
2.
AMRViz enables seamless genomics analysis and visualization of antimicrobial resistance.
BMC Bioinformatics
; 25(1): 193, 2024 May 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38755527
3.
Whole genome deep sequencing analysis of cell-free DNA in samples with low tumour content.
BMC Cancer
; 22(1): 85, 2022 Jan 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35057759
4.
Real-time resolution of short-read assembly graph using ONT long reads.
PLoS Comput Biol
; 17(1): e1008586, 2021 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33471816
5.
Octapeptin C4 and polymyxin resistance occur via distinct pathways in an epidemic XDR Klebsiella pneumoniae ST258 isolate.
J Antimicrob Chemother
; 74(3): 582-593, 2019 03 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30445429
6.
Simulating the dynamics of targeted capture sequencing with CapSim.
Bioinformatics
; 34(5): 873-874, 2018 03 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29092025
7.
GtTR: Bayesian estimation of absolute tandem repeat copy number using sequence capture and high throughput sequencing.
BMC Bioinformatics
; 19(1): 267, 2018 07 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30012093
8.
npInv: accurate detection and genotyping of inversions using long read sub-alignment.
BMC Bioinformatics
; 19(1): 261, 2018 07 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30001702
9.
Real-time demultiplexing Nanopore barcoded sequencing data with npBarcode.
Bioinformatics
; 33(24): 3988-3990, 2017 Dec 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28961965
10.
Robust Estimation of Evolutionary Distances with Information Theory.
Mol Biol Evol
; 33(5): 1349-57, 2016 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26912811
11.
Sequencing technologies and tools for short tandem repeat variation detection.
Brief Bioinform
; 16(2): 193-204, 2015 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24504770
12.
Realtime analysis and visualization of MinION sequencing data with npReader.
Bioinformatics
; 32(5): 764-6, 2016 03 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26556383
13.
Inferring short tandem repeat variation from paired-end short reads.
Nucleic Acids Res
; 42(3): e16, 2014 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24353318
14.
Repeat-encoded poly-Q tracts show statistical commonalities across species.
BMC Genomics
; 14: 76, 2013 Feb 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23374135
15.
Individualized, heterologous chimpanzee adenovirus and self-amplifying mRNA neoantigen vaccine for advanced metastatic solid tumors: phase 1 trial interim results.
Nat Med
; 28(8): 1619-1629, 2022 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35970920
16.
A biological compression model and its applications.
Adv Exp Med Biol
; 696: 657-66, 2011.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21431607
17.
A genome alignment algorithm based on compression.
BMC Bioinformatics
; 11: 599, 2010 Dec 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21159205
18.
Assembly of whole-chromosome pseudomolecules for polyploid plant genomes using outbred mapping populations.
Nat Genet
; 52(11): 1256-1264, 2020 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33128049
19.
Retooling phage display with electrohydrodynamic nanomixing and nanopore sequencing.
Lab Chip
; 19(24): 4083-4092, 2019 12 21.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31712799
20.
Ongoing human chromosome end extension revealed by analysis of BioNano and nanopore data.
Sci Rep
; 8(1): 16616, 2018 11 09.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30413723