Detalles de la búsqueda
1.
Enhancing cryo-EM structure prediction with DeepTracer and AlphaFold2 integration.
Brief Bioinform
; 25(3)2024 Mar 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38609330
2.
Fast and automated protein-DNA/RNA macromolecular complex modeling from cryo-EM maps.
Brief Bioinform
; 24(2)2023 03 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36682003
3.
ComplexQA: a deep graph learning approach for protein complex structure assessment.
Brief Bioinform
; 24(6)2023 09 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37930021
4.
Integrated bulk and single-cell transcriptomes reveal pyroptotic signature in prognosis and therapeutic options of hepatocellular carcinoma by combining deep learning.
Brief Bioinform
; 25(1)2023 11 22.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38197309
5.
Cryo-EM model validation recommendations based on outcomes of the 2019 EMDataResource challenge.
Nat Methods
; 18(2): 156-164, 2021 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33542514
6.
ZoomQA: residue-level protein model accuracy estimation with machine learning on sequential and 3D structural features.
Brief Bioinform
; 23(1)2022 01 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34553747
7.
Application of artificial intelligence and machine learning for COVID-19 drug discovery and vaccine design.
Brief Bioinform
; 22(6)2021 11 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34410360
8.
Protein tertiary structure modeling driven by deep learning and contact distance prediction in CASP13.
Proteins
; 87(12): 1165-1178, 2019 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30985027
9.
A Glycine max sodium/hydrogen exchanger enhances salt tolerance through maintaining higher Na+ efflux rate and K+/Na+ ratio in Arabidopsis.
BMC Plant Biol
; 19(1): 469, 2019 Nov 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31690290
10.
QAcon: single model quality assessment using protein structural and contact information with machine learning techniques.
Bioinformatics
; 33(4): 586-588, 2017 02 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28035027
11.
3Drefine: an interactive web server for efficient protein structure refinement.
Nucleic Acids Res
; 44(W1): W406-9, 2016 07 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27131371
12.
UniCon3D: de novo protein structure prediction using united-residue conformational search via stepwise, probabilistic sampling.
Bioinformatics
; 32(18): 2791-9, 2016 09 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27259540
13.
Integrated protein function prediction by mining function associations, sequences, and protein-protein and gene-gene interaction networks.
Methods
; 93: 84-91, 2016 Jan 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26370280
14.
ProLanGO: Protein Function Prediction Using Neural Machine Translation Based on a Recurrent Neural Network.
Molecules
; 22(10)2017 Oct 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29039790
15.
DeepQA: improving the estimation of single protein model quality with deep belief networks.
BMC Bioinformatics
; 17(1): 495, 2016 Dec 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27919220
16.
Massive integration of diverse protein quality assessment methods to improve template based modeling in CASP11.
Proteins
; 84 Suppl 1: 247-59, 2016 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26369671
17.
Large-scale model quality assessment for improving protein tertiary structure prediction.
Bioinformatics
; 31(12): i116-23, 2015 Jun 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26072473
18.
A large-scale conformation sampling and evaluation server for protein tertiary structure prediction and its assessment in CASP11.
BMC Bioinformatics
; 16: 337, 2015 Oct 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26493701
19.
Iterative reconstruction of three-dimensional models of human chromosomes from chromosomal contact data.
BMC Bioinformatics
; 16: 338, 2015 Oct 23.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26493399
20.
CONFOLD: Residue-residue contact-guided ab initio protein folding.
Proteins
; 83(8): 1436-49, 2015 Aug.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25974172